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1. (WO2011017760) DETECTION AND ANALYSIS OF METHYLATION IN NUCLEIC ACID SEQUENCES
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2011/017760    International Application No.:    PCT/AU2010/001028
Publication Date: 17.02.2011 International Filing Date: 12.08.2010
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), C07H 21/04 (2006.01), G01N 33/50 (2006.01)
Applicants: COMMONWEALTH SCIENTIFIC AND INDUSTRIAL RESEARCH ORGANISATION [AU/AU]; Limestone Avenue Campbell, Australian Capital Territory 2612 (AU) (For All Designated States Except US).
DREW, Horace, R. [AU/AU]; (AU) (For US Only).
MOLLOY, Peter Laurence [AU/AU]; (AU) (For US Only).
BROWN, Glenn S [AU/AU]; (AU) (For US Only)
Inventors: DREW, Horace, R.; (AU).
MOLLOY, Peter Laurence; (AU).
BROWN, Glenn S; (AU)
Agent: RECCHIA, Gavin, Dean; Davies Collison Cave Level 14 255 Elizabeth Street Sydney, New South Wales 2000 (AU)
Priority Data:
2009903788 12.08.2009 AU
Title (EN) DETECTION AND ANALYSIS OF METHYLATION IN NUCLEIC ACID SEQUENCES
(FR) DÉTECTION ET ANALYSE DE MÉTHYLATION DANS DES SÉQUENCES D'ACIDE NUCLÉIQUE
Abstract: front page image
(EN)Provided herein are methods for the identification of methylated cytosine bases in a nucleotide sequence, the method comprising the steps of: (a) generating fragments of a DNA molecule comprising the nucleotide sequence such that the fragments comprise at least one single-stranded terminus comprising one or more bases and wherein at least one base within the single-stranded terminus is an unmethylated cytosine or methylcytosine; (b) incubating the fragments with bisulfite under non-denaturing conditions such that only unmethylated cytosines within the at least one single- stranded terminus are converted to uracil; and (c) detecting fragments comprising methylcytosine or uracil bases in the at least one single-stranded terminus. Also provided are methods for the diagnosis of, or determination of susceptibility to, diseases associated with aberrant cytosine methylation.
(FR)L'invention porte sur des procédés d'identification de bases cytosines méthylées dans une séquence nucléotidique, le procédé comportant les étapes consistant : (a) à produire des fragments d'une molécule d'ADN comportant la séquence nucléotidique de façon à ce que les fragments comportent au moins une extrémité simple brin comportant une ou plusieurs bases, au moins une base présente dans l'extrémité simple brin étant une cytosine non méthylée ou une méthylcytosine ; (b) à incuber les fragments avec du bisulfite dans des conditions non dénaturantes de façon à ce que seules les cytosines non méthylées présentes dans ladite ou lesdites extrémités simple brin soient converties en uracile ; et (c) à détecter les fragments comportant des bases méthylcytosines ou uraciles dans ladite ou lesdites extrémités simple brin. L'invention porte également sur des procédés pour le diagnostic de maladies associées à une méthylation aberrante de cytosine ou pour la détermination de la prédisposition à celles-ci.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)