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1. (WO2010117465) USES FOR LONG POLAR FIMBRIAE GENES OF PATHOGENIC ESCHERICHIA COLI STRAINS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2010/117465    International Application No.:    PCT/US2010/001065
Publication Date: 14.10.2010 International Filing Date: 09.04.2010
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), C12N 15/31 (2006.01), C12R 1/19 (2006.01)
Applicants: THE BOARD OF REGENTS OF THE UNIVERSITY OF TEXAS SYSTEM [US/US]; 201 West Seventh Street Austin, TX 78701 (US) (For All Designated States Except US).
TORRES, Alfredo, G. [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: TORRES, Alfredo, G.; (US)
Agent: ADLER, Benjamin, Aaron; ADLER & ASSOCIATES 8011 Candle Ln. Houston, TX 77071 (US)
Priority Data:
61/212,385 10.04.2009 US
Title (EN) USES FOR LONG POLAR FIMBRIAE GENES OF PATHOGENIC ESCHERICHIA COLI STRAINS
(FR) UTILISATION DES GÈNES LPF (LONG POLAR FIMBRIAE) DE SOUCHES D'ESCHERICHIA COLI PATHOGÈNES
Abstract: front page image
(EN)Provided are methods for identifying lpf genes in pathogenic serotypes of the Enterobacteriaceae family and for differentiating Escherichia coli (E. coli) O157:H7 strains in an isolate using primer pairs specific to lpf gene variants, particularly IpfA1 and/ or lpfA 2 genes and amplicon size of the PCR product to identify prototypic Enterobacteriaceae serotypes or more specifically, to differentiate strains of E. coli serotype O157:1-17. Differentiation further requires identifying the E. coli isolate's eae gene variant type which in combination with the IpfA1 and/or lpfA2 variant identification provides unique markers. Also provided are the primer pairs and a kit comprising the same.
(FR)Cette invention concerne des procédés d'identification des gènes lpf (long polar fimbriae) chez des sérotypes pathogènes de la famille des entérobactéries (Enterobacteriaceae) et de différenciation des souches O157:H7 d'Escherichia coli (E. coli) dans un isolat en utilisant des paires d'amorces spécifiques des variants génétiques de lpf, en particulier les gènes lpfA1 et/ou lpfA2, et une taille d'amplicon du produit de PCR pour identifier des sérotypes prototypiques des entérobactéries ou plus précisément, pour différencier les souches O157:1-17 d'E. coli. La différenciation implique par ailleurs l'identification du type de variant génétique de l'isolat d'E. coli qui, associé avec le variant lpfA1 et/ou lpfA2, produit des marqueurs uniques. L'invention concerne également les paires d'amorces et un kit comportant ces paires d'amorces.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)