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1. (WO2010030716) DETECTION OF NUCLEIC ACIDS BY OLIGONUCLEOTIDE PROBES CLEAVED IN PRESENCE OF ENDONUCLEASE V
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2010/030716    International Application No.:    PCT/US2009/056421
Publication Date: 18.03.2010 International Filing Date: 09.09.2009
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: KUTYAVIN, Igor [RU/US]; (US)
Inventors: KUTYAVIN, Igor; (US)
Agent: DAVISON, Barry, L.; (US)
Priority Data:
61/095,870 10.09.2008 US
Title (EN) DETECTION OF NUCLEIC ACIDS BY OLIGONUCLEOTIDE PROBES CLEAVED IN PRESENCE OF ENDONUCLEASE V
(FR) DÉTECTION D’ACIDES NUCLÉIQUES PAR DES SONDES OLIGONUCLÉOTIDIQUES COUPÉES EN PRÉSENCE D’ENDONUCLÉASE V
Abstract: front page image
(EN)Particular aspects provide nucleic acid detection methods comprising contacting a test sample having a nucleic acid target sequence with at least one endo-V-cleavable oligonucleotide probe complementary to the target sequence in the presence of an endonuclease V, incubating the reaction mixture under conditions suitable to support hybridization of the endo-V-cleavable oligonucleotide probe with the target nucleic acid and endonuclease V-mediated cleavage of the target-hybridized probe, and detecting at least one endonuclease V-mediated cleavage product of the target-hybridized probe wherein the presence of the cleavage products is indicative of the presence of the target nucleic acid sequence in the sample. Particular aspects comprise amplification of the target nucleic acid sequence before and/or during the incubating and/or detecting, wherein detecting is post-amplification and/or real-time. Additional aspects provide suitable kits. Further aspects comprise use of at least one nick-directing modification or other structural modification of the at least one endo-V-cleavable oligonucleotide probe.
(FR)L’invention concerne des procédés de détection d’acides nucléiques comprenant les étapes consistant à mettre en contact un échantillon test ayant une séquence cible d’acides nucléiques pourvus d'au moins une sonde oligonucléotidique pouvant être coupée par une endo V complémentaire de la séquence cible en présence d’une endonucléase V, incuber le mélange réactionnel dans des conditions appropriées pour favoriser l’hybridation de la sonde oligonucléotidique pouvant être coupée par une endo V avec l’acide nucléique cible et la coupure induite par l’endonucléase V de la sonde hybridée à la cible, et détecter au moins un produit de coupure induit par l’endonucléase V de la sonde hybridée à la cible, la présence des produits de coupure étant une indication de la présence de la séquence d’acide nucléique cible dans l’échantillon. Des aspects particuliers comprennent l’amplification de la séquence d’acides nucléiques cibles avant et/ou pendant l’incubation et/ou la détection, la détection étant une post-amplification et/ou en temps réel. Des aspects supplémentaires concernent des kits appropriés. D’autres aspects comprennent l’utilisation d’au moins une modification dirigée par des coupures ou une autre modification structurale d’au moins une sonde oligonucléotidique pouvant être coupée par une endo V.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
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European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)