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1. (WO2010030686) MULTI-STAGE, REGRESSION-BASED PCR ANALYSIS SYSTEM
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2010/030686    International Application No.:    PCT/US2009/056384
Publication Date: 18.03.2010 International Filing Date: 09.09.2009
IPC:
G01N 33/48 (2006.01)
Applicants: BIO-RAD LABORATORIES, INC. [US/US]; 1000 Alfred Nobel Drive Hercules, California 94547 (US) (For All Designated States Except US).
LERNER, Jeffrey [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: LERNER, Jeffrey; (US)
Agent: RACZKOWSKI, David B.; Townsend and Townsend and Crew LLP Two Embarcadero Center, 8th Floor San Francisco, CA 94111-3834 (US)
Priority Data:
61/095,410 09.09.2008 US
Title (EN) MULTI-STAGE, REGRESSION-BASED PCR ANALYSIS SYSTEM
(FR) SYSTÈME D'ANALYSE D'UNE PCR EN PLUSIEURS ÉTAPES ET PAR RÉGRESSION
Abstract: front page image
(EN)Systems and methods are provided for analyzing data to determine properties of a PCR process or other process exhibiting amplification or growth. Data representing an amplification can be distinguished from data representing a jump or other error. A modified sigmoid function containing a drift term may be used in determining the properties. A multi stage functional fit of the amplification data can provide increased accuracy and consistency of one or more of the properties. A baseline of the amplification data can be determined by analyzing an integrated area of a first derivative function of the data. A reference quantitation value can also be determined from locations of maxima of different derivative functions of the amplification data, e.g., a weighted average of the maxima locations for the second and third derivatives may be used.
(FR)La présente invention concerne des systèmes et des procédés permettant d'analyser des données afin de déterminer les propriétés d'un processus de PCR ou de tout autre processus impliquant une amplification ou un développement. Les données représentatives d'une amplification peuvent être distinguées de données représentatives d'un saut ou d'une autre erreur. Une fonction sigmoïde modifiée, contenant un terme correspondant à une dérive, peut être utilisée pour déterminer lesdites propriétés. Un ajustement fonctionnel en plusieurs étapes des données d'amplification peut assurer une précision et une cohérence accrues d'une ou plusieurs desdites propriétés. Une ligne de base associée aux données d'amplification peut être déterminée grâce à l'analyse d'une zone intégrée d'une première fonction dérivée des données. Une valeur quantitative de référence peut également être déterminée à partir de l'emplacement des maxima de différentes fonctions dérivées des données d'amplification ; on peut par exemple utiliser une moyenne pondérée de l'emplacement des maxima pour les deuxième et troisième dérivées.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)