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1. (WO2010027484) ENGINEERING POLYMERASES AND REACTION CONDITIONS FOR MODIFIED INCORPORATION PROPERTIES
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2010/027484    International Application No.:    PCT/US2009/004993
Publication Date: 11.03.2010 International Filing Date: 04.09.2009
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), C12N 15/11 (2006.01), C12Q 1/25 (2006.01)
Applicants: PACIFIC BIOSCIENCES OF CALIFORNIA, INC. [US/US]; 1505 Adams Drive Menlo Park, CA 94025 (US) (For All Designated States Except US).
PATEL, Pranav [IN/US]; (US) (For US Only).
KORLACH, Jonas [DE/US]; (US) (For US Only).
BIBILLO, Arkadiusz [PL/US]; (US) (For US Only).
BJORNSON, Keith [US/US]; (US) (For US Only).
HANES, Jeremiah [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: PATEL, Pranav; (US).
KORLACH, Jonas; (US).
BIBILLO, Arkadiusz; (US).
BJORNSON, Keith; (US).
HANES, Jeremiah; (US)
Agent: LITTLEPAGE, Paul; Quine Intellectual Property Law Group, P.C. P.O. Box 458 Alameda, CA 94501 (US)
Priority Data:
61/094,843 05.09.2008 US
12/370,472 12.02.2009 US
Title (EN) ENGINEERING POLYMERASES AND REACTION CONDITIONS FOR MODIFIED INCORPORATION PROPERTIES
(FR) POLYMÉRASES GÉNÉTIQUEMENT MODIFIÉES ET CONDITIONS RÉACTIONNELLES POUR L'OBTENTION DE PROPRIÉTÉS D'INCORPORATION MODIFIÉES
Abstract: front page image
(EN)Provided are methods for enhanced sequencing of nucleic acid templates. Also provided are reaction conditions that increase branching fractions during polymerization reactions. Also provided are compositions comprising modified recombinant polymerases that exhibit branching fractions that are higher than the branching fractions of the polymerases from which they were derived. Provided are compositions comprising modified recombinant polymerases that exhibit delayed translocation relative to the polymerases from which they were derived. Also provided are compositions comprising modified recombinant polymerases that exhibit increased nucleotide or nucleotide analog residence time at an active site of the polymerase. Provided are methods for generating polymerases with the aforementioned phenotypes and methods of using such polymerases to sequence a DNA template or make a DNA. Also provided are methods and nucleic acid sequencing systems for determining which labeled nucleotide is incorporated at a site during a template-dependent polymerization reaction.
(FR)La présente invention concerne des méthodes permettant un meilleur séquençage de matrices d'acide nucléique. L'invention concerne également des conditions réactionnelles qui augmentent les fractions de ramification pendant les réactions de polymérisation. L'invention porte également sur des compositions contenant des polymérases recombinantes modifiées qui présentent des fractions de ramification qui sont plus importantes que les fractions de ramification des polymérases desquelles elles sont dérivées. L'invention concerne aussi des compositions contenant des polymérases recombinantes modifiées qui présentent une translocation retardée par rapport aux polymérases desquelles elles sont dérivées. Selon l'invention, les compositions peuvent également contenir des polymérases recombinantes modifiées qui présentent un temps de séjour de nucléotides ou d'analogues nucléotidiques augmenté au niveau d'un site actif de la polymérase. L'invention porte également sur des méthodes permettant de produire des polymérases avec les phénotypes susmentionnés et des méthodes d'utilisation de ces polymérases pour séquencer une matrice d'ADN ou fabriquer un ADN. L'invention porte également sur des méthodes et des systèmes de séquençage d'acide nucléique permettant de déterminer quel nucléotide marqué a été incorporé en un site particulier pendant une réaction de polymérisation dépendant de la matrice.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)