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1. WO2010007605 - A METHOD OF ASSESSING BACTERIAL LOAD OF A SAMPLE

Publication Number WO/2010/007605
Publication Date 21.01.2010
International Application No. PCT/IE2009/000047
International Filing Date 15.07.2009
IPC
C12Q 1/68 2006.01
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68involving nucleic acids
CPC
C12Q 1/689
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
6888for detection or identification of organisms
689for bacteria
Applicants
  • AGRICULTURE AND FOOD DEVELOPMENT AUTHORITY (TEAGASC) [IE]/[IE] (AllExceptUS)
  • BURGESS, Kaye [IE]/[IE] (UsOnly)
  • DUFFY, Geraldine [IE]/[IE] (UsOnly)
  • DOLAN, Anthony [IE]/[IE] (UsOnly)
Inventors
  • BURGESS, Kaye
  • DUFFY, Geraldine
  • DOLAN, Anthony
Agents
  • PURDY, Hugh, Barry
Priority Data
08012825.916.07.2008EP
Publication Language English (EN)
Filing Language English (EN)
Designated States
Title
(EN) A METHOD OF ASSESSING BACTERIAL LOAD OF A SAMPLE
(FR) PROCÉDÉ D'ÉVALUATION D'UNE CHARGE BACTÉRIENNE D'UN ÉCHANTILLON
Abstract
(EN)
A method of determining a bacterial load of a food product, especially a meat carcass, comprises the steps of processing a sample of nucleic acid isolated from the food product to amplify and quantify a target region associated gram positive bacteria, and a target region associated with gram negative bacteria, and correlating the quantity of amplified target regions with a bacterial load value for the food product. The target region associated with gram positive bacteria is amplified using a primer set comprising of SEQUENCE ID NO. 3 (gram positive forward primer) or a functional fragment thereof, and SEQUENCE ID NO. 4 (gram positive reverse primer) or a functional fragment thereof. The target region associated with gram negative bacteria is amplified using a primer set comprising of SEQUENCE ID NO. 5 (gram negative forward primer) or a functional fragment thereof, and SEQUENCE ID NO. 6 (gram negative reverse primer) or a functional fragment thereof. A kit of parts for performing the method of the invention is also described.
(FR)
L'invention porte sur un procédé de détermination d'une charge bactérienne d'un produit alimentaire, en particulier d'une carcasse de viande. Ce procédé consiste à traiter un échantillon d'acide nucléique isolé à partir du produit alimentaire pour amplifier et quantifier une région cible associée aux bactéries Gram positif, et une région cible associée aux bactéries Gram négatif, et à corréler la quantité de régions cibles amplifiées avec une valeur de charge bactérienne pour le produit alimentaire. La région cible associée aux bactéries Gram positif est amplifiée à l'aide d'un ensemble d'amorces comprenant la séquence ID NO. 3 (amorce directe Gram positif) ou un fragment fonctionnel de celle-ci, et la séquence ID NO. 4 (amorce inverse Gram positif) ou un fragment fonctionnel de celle-ci. La région cible associée aux bactéries Gram négatif est amplifiée à l'aide d'un ensemble d'amorces comprenant la séquence ID NO. 5 (amorce directe Gram négatif) ou un fragment fonctionnel de celle-ci, et la séquence ID NO. 6 (amorce inverse Gram négatif) ou un fragment fonctionnel de celle-ci. L'invention porte également sur un kit de pièces pour la mise en œuvre du procédé de l'invention.
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