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1. (WO2009132860) SUBSTANCES AND METHODS FOR A DNA BASED PROFILING ASSAY
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2009/132860    International Application No.:    PCT/EP2009/003351
Publication Date: 05.11.2009 International Filing Date: 24.04.2009
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: BIOTYPE GMBH [DE/DE]; Moritzburger Weg 67 01109 Dresden (DE).
BÖHME, Manja [DE/DE]; (DE) (For US Only).
GABERT, Jôrg [DE/DE]; (DE) (For US Only).
BRABETZ, Werner [DE/DE]; (DE) (For US Only)
Inventors: BÖHME, Manja; (DE).
GABERT, Jôrg; (DE).
BRABETZ, Werner; (DE)
Agent: KILGER, Christian; Vossius & Partner Siebertstraße 4 81675 München (DE)
Priority Data:
08155280.4 28.04.2008 EP
Title (EN) SUBSTANCES AND METHODS FOR A DNA BASED PROFILING ASSAY
(FR) SUBSTANCES ET PROCÉDÉS POUR UN ESSAI DE PROFILAGE À BASE D'ADN
Abstract: front page image
(EN)The present invention relates to a DNA profiling assay comprising the following steps, providing a sample to be analyzed, providing reagents, enzyme and primeroligonucleotides which are necessary for simultaneous polymerase chain reaction amplification of at least 20 loci, amplifying the loci, detecting the amplification products, wherein the amplification products and the loci to be amplified are characterized by the following features, each locus to be amplified is characterized by at least one deletion-insertion polymorphism known to be present in the population, wherein the two alleles from each locus differ in size by more than 2 nucleotides and less than 100 nucleotides, a first set of at least two amplification products ranging in size from about 20 nucleotides to about 300 nucleotides stemming from at least two different loci carries a first label, a second set of at least two amplification products ranging in size from about 20 nucleotides to about 300 nucleotides stemming from at least two different loci carries a second label, a third set of at least two amplification products ranging in size from about 20 nucleotides to about 300 nucleotides stemming from at least two different loci carries a third label, label one, label two and label three are each different fluorescent labels which can be differentiated and simultaneously detected by a multi-colour detector in combination with, e.g. a DNA sequencing device.
(FR)La présente invention concerne un essai de profilage d'ADN comprenant les étapes suivantes, consistant à fournir un échantillon à analyser, fournir des réactifs, une enzyme et des oligonucléotides d'amorce qui sont nécessaires pour l'amplification simultanée par réaction de polymérase en chaîne d'au moins 20 locus, amplifier les locus, détecter les produits d'amplification, où les produits d'amplification et les locus à amplifier sont caractérisés en ce que chaque locus à amplifier est caractérisé par au moins un polymorphisme de délétion-insertion connu comme étant présent dans la population, où les deux allèles de chaque locus diffèrent en terme de taille de plus de 2 nucléotides et de moins de 100 nucléotides, un premier ensemble d'au moins deux produits d'amplification dans une plage de tailles d'environ 20 nucléotides à environ 300 nucléotides, issus d'au moins deux locus différents comporte un premier marqueur, un deuxième ensemble d'au moins deux produits d'amplification dans une plage de tailles d'environ 20 nucléotides à environ 300 nucléotides, issus d'au moins deux locus différents comporte un deuxième marqueur, un troisième ensemble d'au moins deux produits d'amplification dans une plage de tailles d'environ 20 nucléotides à environ 300 nucléotides, issus d'au moins deux locus différents comporte un troisième marqueur, le marqueur un, le marqueur deux et le marqueur trois sont chacun des marqueurs fluorescents différents qui peuvent être différenciés et simultanément détectés par un détecteur multi-couleur en combinaison avec, par exemple, un dispositif de séquençage d'ADN.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)