WIPO logo
Mobile | Deutsch | Español | Français | 日本語 | 한국어 | Português | Русский | 中文 | العربية |
PATENTSCOPE

Search International and National Patent Collections
World Intellectual Property Organization
Search
 
Browse
 
Translate
 
Options
 
News
 
Login
 
Help
 
Machine translation
1. (WO2009067034) COMPUTER-BASED MODELING AND DESIGNING OF PHOSPHOFRUCTOKINASE 1 (PFK) MODULATORS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2009/067034    International Application No.:    PCT/PL2008/000088
Publication Date: 28.05.2009 International Filing Date: 25.11.2008
Chapter 2 Demand Filed:    04.01.2010    
IPC:
G06F 19/00 (2011.01)
Applicants: INSTYTUT CHEMII BIOORGANICZNEJ PAN [PL/PL]; ul. Noskowskiego 12/14 PL-61-704 Poznan (PL) (For All Designated States Except US).
RYPNIEWSKI, Wojciech [PL/PL]; (PL) (For US Only).
BANASZAK, Katarzyna [PL/PL]; (PL) (For US Only).
MECHIN, Ingrid [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: RYPNIEWSKI, Wojciech; (PL).
BANASZAK, Katarzyna; (PL).
MECHIN, Ingrid; (US)
Agent: TWARDOWSKA, Aleksandra; Jan Wierzchon & Partners Patent and Trademark Attorneys ul. Zurawia 47/49 PL-00-950 Warszawa (PL)
Priority Data:
P-383866 25.11.2007 PL
Title (EN) COMPUTER-BASED MODELING AND DESIGNING OF PHOSPHOFRUCTOKINASE 1 (PFK) MODULATORS
(FR) MODÈLE CRISTALLOGRAPHIQUE DU SITE DE LIAISON ET MODULATEUR DE RÉGULATION DE L'ACTIVITÉ CATALYTIQUE DE LA PHOSPHOFRUCTOKINASE (PFK), PROCÉDÉ DE CONCEPTION, DE SÉLECTION ET DE PRODUCTION DU MODULATEUR DE PFK, PROCÉDÉ INFORMATISÉ D'ANALYSE DES INTERACTIONS ENTRE LE MODULATEUR ET LA PFK, PROCÉDÉ INFORMATISÉ D'ANALYSE DE MOL
Abstract: front page image
(EN)The subject matters of the invention are: a crystallographic model of the binding site and a modulator regulating the catalytic activity of phosphofructokinase (PFK), a method of designing, selecting and producing a PFK modulator, a computer-based method for the analysis of the interaction between the modulator and PFK, a computer-based method the analysis of molecular structures, a method of assessing the ability of the potential modulator to interact in the binding site on the PFK surface, a method of providing data for generating structures and/or performing design for ligands binding PFK, PFK homologues or analogues, complexes of PFK with a potential modulator, or complexes of PFK homologues or analogues with potential modulators, a computer system. The invention makes it possible to design a suitable activator, which could be used to modulate PFK activity, taking advantage of PFKs capability to bind in its effector site phosphate groups or other groups with a similar potential to interact, which correspond with the substituents in positions 1, 2 and 6 of the fructose ring, or groups corresponding with positions of the fructose ring groups interacting in the PFK effector site.
(FR)La présente invention concerne un modèle cristallographique du site de liaison et un modulateur de régulation de l'activité catalytique de la phosphofructokinase (PFK), un procédé de conception, de sélection et de production d'un modulateur de PFK, un procédé informatisé destiné à l'analyse des interactions entre le modulateur et la PFK, un procédé informatisé destiné à l'analyse de structures moléculaires, un procédé d'évaluation de la capacité du modulateur potentiel d'interagir dans le site de liaison sur la surface de la PFK, un procédé de fourniture de données permettant de générer des structures et/ou de concevoir des ligands se liant à la PFK, à des homologues ou des analogues de la PFK, à des complexes de la PFK avec un modulateur potentiel, ou à des complexes d'homologues ou d'analogues de la PFK avec des modulateurs potentiels. L'invention concerne également un système informatique. Selon l'invention, il est possible de concevoir un activateur approprié, qui pourrait être utilisé pour moduler l'activité de la PFK, en tirant avantage de la capacité de la PFK de se lier au niveau de son site effecteur à des groupes phosphates ou à d'autres groupes dotés d'un potentiel similaire d'interaction, lesdits groupes correspondant aux substituants en positions 1, 2 et 6 de l'anneau de fructose, ou à des groupes correspondant aux positions des groupes de l'anneau de fructose qui interagissent au niveau du site effecteur de la PFK.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MT, NL, NO, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)