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1. (WO2009065711) METHOD AND ARRANGEMENT FOR CALIBRATING A SENSOR ELEMENT
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2009/065711    International Application No.:    PCT/EP2008/064680
Publication Date: 28.05.2009 International Filing Date: 29.10.2008
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: SIEMENS AKTIENGESELLSCHAFT [DE/DE]; Wittelsbacherplatz 2, 80333 München (DE) (For All Designated States Except US).
FRIEDRICH, Katja [DE/DE]; (DE) (For US Only).
GUMBRECHT, Walter [DE/DE]; (DE) (For US Only).
PAULICKA, Peter [SK/DE]; (DE) (For US Only).
STANZEL, Manfred [DE/DE]; (DE) (For US Only).
WEBER, Renee [DE/DE]; (DE) (For US Only)
Inventors: FRIEDRICH, Katja; (DE).
GUMBRECHT, Walter; (DE).
PAULICKA, Peter; (DE).
STANZEL, Manfred; (DE).
WEBER, Renee; (DE)
Agent: SIEMENS AG; CT IP S AE, Postfach 22 16 34, 80506 München (DE)
Priority Data:
10 2007 055 386.4 20.11.2007 DE
Title (DE) VERFAHREN UND ANORDNUNG ZUR KALIBRIERUNG EINES SENSORELEMENTS
(EN) METHOD AND ARRANGEMENT FOR CALIBRATING A SENSOR ELEMENT
(FR) PROCÉDÉ ET AGENCEMENT POUR ÉTALONNER UN ÉLÉMENT CAPTEUR
Abstract: front page image
(DE)Die vorliegende Erfindung bezieht sich auf ein Verfahren zur Kalibrierung eines Sensorelements, welcher ein immobilisiertes Sondenoligonukleotid aufweist, über welches die Bindung einer Ziel-Nukleinsäure (Z) durch den Sensor erfasst werden kann, aufweisend: a) in Kontakt Bringen des Sensorelements mit einer Kontrollnukleinsäure (K) deren Schmelztemperatur Tm(K) kleiner ist als die Schmelztemperatur Tm(Z) der Zielnukleinsäure (Z); b) Hybridisieren der Kontrollnukleinsäure (K) an das Sondenoligonukleotid bei einer Temperatur T[p]<Tm(K), und erfassen eines Positiv-Kontrollsignals; und optional c) Verändern der Stringenzbedingungen, so dass T[n] > Tm(K) und erfassen eines Negativ-Kontrollsignals bei einer Temperatur T[n]. Gemäß einer Weiterbildung der Erfindung wird bei einer Messtemperatur T [mess], wobei Tm(K) < T[mess] < Tm(Z), ein Messsignal der Zielnukleinsäure (Z) gemessen. Das Verfahren eignet sich insbesondere zur Kalibrierung und Qualitätskontrolle von Microarrays.
(EN)The present invention relates to a method for calibrating a sensor element, which has an immobilized probe oligonucleotide, via which the bonding of a target nucleic acid (Z) can be detected by the sensor, comprising: a) bringing the sensor element into contact with a control nucleic acid (K), the melting temperature Tm(K) of which is less than the melting temperature Tm(Z) of the target nucleic acid (Z); b) hybridizing the control nucleic acid (K) to the probe oligonucleotide at a temperature T[p] Tm(K) and detecting a negative control signal at a temperature T[n]. According to a refinement of the invention, a measuring signal of the target nucleic acid (Z) is measured at a measuring temperature T [mess], where Tm(K) < T[mess] < Tm(Z). The method is suited in particular for the calibration and quality control of microarrays.
(FR)La présente invention concerne un procédé pour étalonner un élément capteur qui présente une sonde oligonucléotidique immobilisée permettant d'effectuer la liaison d'un acide nucléique cible (Z) grâce au capteur, ledit procédé comprenant les étapes suivantes : a) la mise en contact de l'élément capteur avec un acide nucléique témoin (K) dont la température de fusion Tm(K) est inférieure à la température de fusion Tm(Z) de l'acide nucléique cible (Z) ; b) l'hybridation de l'acide nucléique témoin (K) sur la sonde oligonucléotidique à une température T[p] Tm(K) et l'acquisition d'un signal de contrôle négatif à une température T[n]. Selon une amélioration de l'invention, on mesure un signal de mesure de l'acide nucléique cible (Z) à une température de mesure T[mess], où Tm(K) < T[mess] < Tm(Z). Le procédé est notamment adapté pour étalonner et contrôler la qualité des microréseaux.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MT, NL, NO, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: German (DE)
Filing Language: German (DE)