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1. (WO2007092849) METHODS FOR DETECTING PEAKS IN A NUCLEIC ACID DATA TRACE
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2007/092849    International Application No.:    PCT/US2007/061698
Publication Date: 16.08.2007 International Filing Date: 06.02.2007
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), G06F 19/00 (2006.01)
Applicants: SIEMENS HEALTHCARE DIAGNOSTICS INC. [US/US]; 511 Benedict Avenue, Tarrytown, NY 10591 (US) (For All Designated States Except US).
IZMAILOV, Alexandre, M. [CA/CA]; (CA) (For US Only).
YUWARAJ, Murugathas [CA/CA]; (CA) (For US Only)
Inventors: IZMAILOV, Alexandre, M.; (CA).
YUWARAJ, Murugathas; (CA)
Agent: POLLACK, Noam; Siemens Healthcare Diagnostics Inc., 511 Benedict Avenue, Tarrytown, NY 10591 (US)
Priority Data:
60/765,507 06.02.2006 US
Title (EN) METHODS FOR DETECTING PEAKS IN A NUCLEIC ACID DATA TRACE
(FR) MÉTHODES PERMETTANT DE DÉTECTER DES PICS DANS UNE TRACE DE VARIABLES D'ACIDE NUCLÉIQUE
Abstract: front page image
(EN)The present invention relates to methods and apparatus for detecting peaks in a sample nucleic acid data trace derived from a sample polynucleotide by (a) receiving a sequence signature of a reference polynucleotide, wherein the sequence signature comprises a profile of peak height at one or more peak position of a nucleic acid sequence data trace of one or more of reference polynucleotides; (b) receiving a sample nucleic acid sequence data trace of a sample polynucleotide corresponding to the reference polynucleotide, wherein the sample nucleic acid sequence data trace comprises a value of peak height at one or more peak position corresponding to the peak positions of the sequence signature; and (c) detecting peaks in the sample nucleic acid data trace having a peak height that correlates with the profile of peak height of the sequence signature at a corresponding peak position.
(FR)L'invention concerne des méthodes et des appareils permettant de détecter des pics dans une trace de variables d'un échantillon d'acide nucléique dérivé d'un échantillon de polynucléotide. Cette méthode consiste : (a) à recevoir une signature de séquence d'un polynucléotide de référence, cette signature de séquence comprenant un profil de hauteur de pic sur une ou plusieurs positions de pic d'une trace de variables d'une séquence d'acide nucléique d'un ou plusieurs polynucléotides de référence ; (b) à recevoir une trace de variables d'une séquence d'un échantillon d'acide nucléique correspondant au polynucléotide de référence, cette trace de variables d'une séquence d'un échantillon d'acide nucléique présentant une valeur de hauteur de pic sur une ou plusieurs positions de pic correspondant aux positions de pic de la signature de séquence ; et (c) à détecter des pics dans la trace de variables d'un échantillon d'acide nucléique présentant une hauteur de pic qui est corrélée avec le profil de hauteur de pic de la signature de séquence sur une position de pic correspondante.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, LY, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)