WIPO logo
Mobile | Deutsch | Español | Français | 日本語 | 한국어 | Português | Русский | 中文 | العربية |
PATENTSCOPE

Search International and National Patent Collections
World Intellectual Property Organization
Search
 
Browse
 
Translate
 
Options
 
News
 
Login
 
Help
 
Machine translation
1. (WO2007084433) ARRAY-BASED POLYMORPHISM MAPPING AT SINGLE NUCLEOTIDE RESOLUTION
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2007/084433    International Application No.:    PCT/US2007/000987
Publication Date: 26.07.2007 International Filing Date: 12.01.2007
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: THE TRUSTEES OF PRINCETON UNIVERSITY [US/US]; 4 New South Building, Princeton, NJ 08544-0036 (US) (For All Designated States Except US).
KRUGLYAK, Leonid [US/US]; (US) (For US Only).
BOTSTEIN, David [US/US]; (US) (For US Only).
GRESHAM, David [US/US]; (US) (For US Only).
RUDERFER, Douglas [US/US]; (US) (For US Only).
PRATT, Stephen [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: KRUGLYAK, Leonid; (US).
BOTSTEIN, David; (US).
GRESHAM, David; (US).
RUDERFER, Douglas; (US).
PRATT, Stephen; (US)
Agent: COLBY, Gary, D.; Duane Morris Llp, 30 S 17th Street, Philadelphia, PA 19119 (US)
Priority Data:
60/759,099 13.01.2006 US
60/779,613 06.03.2006 US
Title (EN) ARRAY-BASED POLYMORPHISM MAPPING AT SINGLE NUCLEOTIDE RESOLUTION
(FR) POLYMORPHISME A BASE SEQUENTIELLE CARTOGRAPHIANT A UNE RESOLUTION DE NUCLEOTIDE SIMPLE
Abstract: front page image
(EN)Disclosed herein is a system useful for detecting sequence differences (e.g., single- nucleotide polymorphisms) between genomes using data from a single hybridization with a genomic DNA microarray, such as a whole-genome array. The methods described herein can be used to detect, simply and inexpensively, differences in sequence among the genomes of individual members of a species, for example. In examples described herein, the system and methods were used to detect a variety of spontaneous single base-pair substitutions, insertions and deletions, and most (>90%) of the approximately 30,000 known single-nucleotide polymorphisms between two Saccharomyces cerevisiae strains. The system and methods were also used to elucidate the genetic basis of phenotypic variants and identify the small number of single base-pair changes accumulated during experimental evolution of yeast.
(FR)La présente invention concerne un système utile pour détecter des différences de séquences (par ex. des polymorphismes simples nucléotides) entre des génomes utilisant des données à partir d’une hybridation simple avec une puce à ADN génomique, telle qu’une séquence complète de génome. Les procédés décrits ici peuvent être utilisés pour détecter, de façon complète et peu onéreuse, des différences dans des séquences parmi les génomes de différents membres d’une espèce, par exemple. Dans des exemples décrits ici, le système et les procédés ont été utilisés pour détecter plusieurs substitutions spontanées d’une paire de base unique, des insertions et des délétions, et la plupart (> 90 %) des environ 30 000 polymorphismes de nucléotides simples connus entre deux souches de Saccharomyces cerevisiae. Le système et les procédés ont également été utilisés afin d’élucider la base génétique de variantes phénotypiques et d’identifier le petit nombre de modifications de paires de bases uniques accumulées durant l'évolution expérimentale d'une levure.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, LY, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)