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1. (WO2007022543) METHODS AND KITS FOR DISTINGUISHING BETWEEN SPECIFIC AND NON-SPECIFIC PROTEIN ASSOCIATIONS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2007/022543    International Application No.:    PCT/US2006/032967
Publication Date: 22.02.2007 International Filing Date: 21.08.2006
IPC:
A61B 5/055 (2006.01)
Applicants: ROCKEFELLER UNIVERSITY [US/US]; 1230 York Avenue, New York, NY 11021-6399 (US) (For All Designated States Except US).
CHAIT, Brian, T. [ZA/US]; (US) (For US Only).
TACKETT, Alan, J. [US/US]; (US) (For US Only).
DEGRASSE, Jeffrey, A. [US/US]; (US) (For US Only).
OEFFINGER, Marlene [DE/US]; (US) (For US Only).
ROUT, Michael, P. [GB/US]; (US) (For US Only).
SEKEDAT, Matthew, D. [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: CHAIT, Brian, T.; (US).
TACKETT, Alan, J.; (US).
DEGRASSE, Jeffrey, A.; (US).
OEFFINGER, Marlene; (US).
ROUT, Michael, P.; (US).
SEKEDAT, Matthew, D.; (US)
Agent: FEIT, Irving, N.; HOFFMANN & BARON, LLP, 6900 Jericho Turnpike, Syosset, NY 11791 (US)
Priority Data:
60/709,536 19.08.2005 US
Title (EN) METHODS AND KITS FOR DISTINGUISHING BETWEEN SPECIFIC AND NON-SPECIFIC PROTEIN ASSOCIATIONS
(FR) METHODES ET TROUSSES PERMETTANT DE DISTINGUER DES ASSOCIATIONS DE PROTEINES SPECIFIQUES ET NON SPECIFIQUES
Abstract: front page image
(EN)The present invention is method of determining whether or not associations between a given protein and other proteins in a cell are specific. The method comprises (a) providing a first sample of the cells in which the given protein contains a tag, (b) providing a second sample of the same cells, wherein the given protein and the other proteins are metabolically labeled, and wherein neither the given protein nor the other proteins are tagged, (c) mixing and lysing the first cell sample and the second cell sample to provide a mixture of proteins, (d) binding the tag of the given protein to a substrate, (e) isolating proteins associated with the tagged given protein bound to the substrate, whereby the associated proteins comprise: (i) proteins specifically associated with the tagged given protein, (H) proteins non-specifically associated with the tagged given protein, or (Hi) a combination thereof, (f) determining whether each associated protein is unlabeled or a mixture of labeled and unlabeled proteins, wherein if the associated protein is not labeled, then that protein was specifically associated in the cell with the tagged given protein.
(FR)La présente invention concerne une méthode permettant de déterminer si des associations entre des protéines données et d'autres protéines à l'intérieur d'une cellule sont spécifiques. Cette méthode consiste (a) à utiliser un premier échantillon des cellules dans lesquelles la protéine donnée contient un marqueur, (b) à utiliser un second échantillon des mêmes cellules dans lesquelles la protéine donnée et les autres protéines sont marquées sur le plan métabolique, mais ni la protéine donnée ni les autres protéines sont marquées, (c) à mélanger et à lyser le premier échantillon de cellules et le second échantillon de cellules pour obtenir un mélange de protéines, (d) à fixer le marqueur de la protéine donnée à un substrat, (e) à isoler les protéines associées à la protéine donnée marquée, fixée au substrat, les protéines associées comprenant (i) des protéines associées de façon spécifique à la protéine donnée marquée, (ii) des protéines associées de façon non spécifique à la protéine donnée marquée ou (iii) un mélange de protéines associées de façon spécifique et non spécifique, la méthode consistant finalement (f) à déterminer si chaque protéine associée est une protéine non marquée ou un mélange de protéines marquées et non marquées. Si la protéine associée est une protéine non marquée, alors la protéine est associée de manière spécifique à l'intérieur de la cellule à la protéine donnée marquée.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, LY, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)