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1. (WO2007013671) METHOD OF DIAGNOSING ESOPHAGEAL CANCER
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2007/013671    International Application No.:    PCT/JP2006/315342
Publication Date: 01.02.2007 International Filing Date: 26.07.2006
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: ONCOTHERAPY SCIENCE, INC. [JP/JP]; 2-1, Sakado 3-chome, Takatsu-ku, Kawasaki-shi, Kanagawa, 2130012 (JP) (For All Designated States Except US).
THE UNIVERSITY OF TOKYO [JP/JP]; 3-1, Hongo 7-chome, Bunkyo-ku, Tokyo, 1138654 (JP) (For All Designated States Except US).
NAKAMURA, Yusuke [JP/JP]; (JP) (For US Only).
DAIGO, Yataro [JP/JP]; (JP) (For US Only).
NAKATSURU, Shuichi [JP/JP]; (JP) (For US Only)
Inventors: NAKAMURA, Yusuke; (JP).
DAIGO, Yataro; (JP).
NAKATSURU, Shuichi; (JP)
Agent: SHIMIZU, Hatsushi; Kantetsu Tsukuba Bldg. 6F, 1-1-1, Oroshi-machi, Tsuchiura-shi, Ibaraki 3000847 (JP)
Priority Data:
60/703,263 27.07.2005 US
Title (EN) METHOD OF DIAGNOSING ESOPHAGEAL CANCER
(FR) PROCÉDÉ DE DIAGNOSTIC DU CANCER DE L'OESOPHAGE
Abstract: front page image
(EN)In order to identify the molecules involved in esophageal carcinogenesis and those to be useful for diagnostic markers as well as targets for new drugs and immunotherapy, a cDNA microarray representing 32,256 genes was constructed to analyze the expression profiles of 19 esophageal squamous-cell carcinomas (ESCCS) purified by laser-capture microdissection. A detailed genome-wide database for sets of genes that are significantly up- or down-regulated in esophageal cancer is disclosed herein. These genes find use in the development of therapeutic drugs or immunotherapy as well as tumor markers. Additionally, genes associated with lymph-node metastasis and post-surgery recurrence are disclosed herein. Among the candidate molecular target genes, a Homo sapiens epithelial cell transforming sequence 2 oncogene (ECT2) and a cell division cycle 45, S. cerevisiae, homolog-like (CDC45L) are further characterized. Treatment of ESCC cells with small interfering RNAs (siRNAs) of ECT2 or CDC45L suppressed growth of the cancer cells. Thus, the data herein provide valuable information for identifying diagnostic systems and therapeutic target molecules for esophageal cancer. Furthermore, the present inventors have identified DKK1 as a potential biomarker for diagnosis of cancer such as lung and esophageal cancers as well as prediction of the poor prognosis of the patients with these diseases. DKK1 was specifically over-expressed in most lung and esophageal cancer tissues the present inventors examined, and was elevated in the sera of a large proportion of patients with these tumors. DKK1, combined with other tumor markers, could significantly improve the sensitivity of cancer diagnosis. Moreover, this molecule is also a likely candidate for development of therapeutic approaches such as antibody therapy.
(FR)En vue de l'identification des molécules impliquées dans la carcinogenèse de l'oesophage et celles pouvant être utiles en tant que marqueurs diagnostiques ainsi qu'en tant que cibles pour de nouveaux médicaments et l'immunothérapie, on a construit un jeu ordonné de microéchantillons d'ADNc représentant 32,236 gènes pour l'analyse de profils d'expression de 19 carcinomes de cellules squameuses de l'oesophage (ESCCS) purifiées par la microdissection de capture par laser. L'invention a trait à une base de données détaillée à l'échelle du génome pour des ensembles de gènes qui sont nettement régulés positivement ou négativement dans le cancer de l'oesophage. Ces gènes trouvent leur application dans le développement de médicaments ou d'immunothérapie ainsi que comme marqueurs tumoraux. L'invention a trait en outre à des gènes associés à la métastase de noeud lymphatique et la récurrence post-chirurgicale. Parmi les gènes cibles moléculaires candidats, un oncogène de séquence 2 de transformation de cellules épithéliales d'Homo sapiens (ECT2) et un cycle de division cellulaire 45, de type homologue de S.cerevisiae (CDC45L) sont davantage caractérisés. Le traitement de cellules squameuses de l'oesophage (ESCC) avec des petits ARN interférents (ARNsi) d'ECT2 ou de CDC45L a supprimé la croissance des cellules cancéreuses. Ainsi, les données de l'invention fournissent une information de valeur pour l'identification de systèmes de diagnostic et de molécules thérapeutiques cibles pour le cancer de l'oesophage. En outre, les auteurs de la présente invention on identifié le DKK1 comme un biomarqueur potentiel pour le diagnostic du cancer tel que les cancers du poumon et de l'oesophage et la prédiction du pronostic insuffisant des patients atteints de ces maladies. Le DKK1 a été surexprimé dans la majorité de tissus du cancer du poumon et de l'oesophage que les auteurs de la présente invention ont examiné, et était élevé dans les sérums d'une grande proportion de patients atteints de ces maladies. Le DKK1, en combinaison avec d'autres marqueurs tumoraux, pourraient améliorer la sensibilité du diagnostic due cancer. En outre, cette molécule est également un candidat potentiel pour le développement de techniques thérapeutiques telles que la thérapie par anticorps.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, LY, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)