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1. (WO2007008693) GENE METHYLATION AS A BIOMARKER IN SPUTUM
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2007/008693    International Application No.:    PCT/US2006/026571
Publication Date: 18.01.2007 International Filing Date: 10.07.2006
Chapter 2 Demand Filed:    28.06.2007    
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), G01N 33/48 (2006.01)
Applicants: LOVELACE RESPIRATORY RESEARCH INSTITUTE [US/US]; Belinsky, Steven, A., 2425 Ridgecrest Drive, S.E., Albuquerque, NM 87108-5127 (US) (For All Designated States Except US).
BELINSKY, Steven, A. [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: BELINSKY, Steven, A.; (US)
Agent: VILVEN, Janeen; Peacock Myers, P.C., P.O. Box 26927, Albuquerque, NM 87125-6927 (US)
Priority Data:
60/698,208 09.07.2005 US
Title (EN) GENE METHYLATION AS A BIOMARKER IN SPUTUM
(FR) METHYLATION DE GENES EN TANT QUE BIOMARQUEUR DANS LES EXPECTORATIONS
Abstract: front page image
(EN)A method to monitor the health of a subject comprising obtaining a test sample containing DNA from the subject; subjecting the DNA to bisulfite modification; expanding the number of copies of at least one gene selected from pi 6, MGMT, DAPK, PAX5-alpha, PAX5-beta, RASSFlA, DAB-2, DAL-I, RASSF2A, GATA5, and GAT A4 by using a polymerase chain reaction with a first primer set to amplify a portion of the gene where the promoter methylation resides, thereby generating an amplification product; using an aliquot of the amplification product generated by the first polymerase chain reaction in a second, methylation-specific, polymerase chain reaction with a second set of primers having a temperature of annealing that exceeds the melting temperature, to detect the presence of inactivation of the at least one specific gene selected from pi 6, MGMT, DAPK, PAX5-alpha, PAX5-beta, RASSFlA, DAB-2, DAL-I, RASSF2A, GATA5, and GATA to monitor the health of the subject.
(FR)Méthode de surveillance de la santé d'un sujet qui consiste à obtenir un échantillon d'analyse contenant de l'ADN du sujet, à soumettre l'ADN à la modification par le bisulfite, à augmenter le nombre de copies d'au moins un gène choisi parmi p16, MGMT, DAPK, PAX5-alpha, PAX5-bêta, RASSF1A, DAB-2, DAL-1, RASSF2A, GATA5 et GATA4 à l'aide de l'amplification par la polymérase avec un premier groupe d'amorces pour amplifier une partie du gène où réside le promoteur de méthylation, ce qui permet d'obtenir un produit d'amplification, à utiliser un aliquote du produit d'amplification produit par la première amplification par la polymérase dans une seconde amplification par la polymérase spécifique de la méthylation avec un second groupe d'amorces ayant une température d'annelage qui dépasse la température de fusion, pour détecter l'inactivation du (des) gène(s) spécifique(s) choisi(s) parmi p16, MGMT, DAPK, PAX5-alpha, PAX5-bêta, RASSF1A, DAB-2, DAL-1, RASSF2A, GATA5 et GATA, et surveiller ainsi la santé du sujet.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, LY, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)