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1. (WO2007008307) DATA CORRECTION, NORMALIZATION AND VALIDATION FOR QUANTITATIVE HIGH-THROUGHPUT METABOLOMIC PROFILING
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2007/008307    International Application No.:    PCT/US2006/021317
Publication Date: 18.01.2007 International Filing Date: 31.05.2006
IPC:
G01N 33/48 (2006.01)
Applicants: KANANI, Harin [IN/US]; (US) (For All Designated States Except US).
KLAPA, Maria, I. [GR/US]; (US) (For All Designated States Except US)
Inventors: KANANI, Harin; (US).
KLAPA, Maria, I.; (US)
Agent: CROSBY, Hans, J.; 1725 DUKE STREET, Suite 240, Alexandria, VA 22314 (US)
Priority Data:
60/698,051 11.07.2005 US
11/362,717 28.02.2006 US
Title (EN) DATA CORRECTION, NORMALIZATION AND VALIDATION FOR QUANTITATIVE HIGH-THROUGHPUT METABOLOMIC PROFILING
(FR) CORRECTION, NORMALISATION ET VALIDATION DE DONNEES POUR PROFILAGE METABOLOMIQUE QUANTITATIF A HAUT RENDEMENT
Abstract: front page image
(EN)Metabolomic profiling of a biological sample using a separation-molecular ID process, such as gas chromatograpliy-mass spectrometry ('GC-MS'), requires the derivatization of the original sample. Quantitative GC-MS metabolomics is possible if the derivative is in one-to-one proportional relationship with the original concentration profile, wherein the proportionality remaining constant among samples. Two types of biases may be introduced into determination of a metabolomic profile to alter these conditions. The first type of bias is produced by a change in the proportionality size between profiles and is corrected by way of an internal standard. The second type of bias may distort the one-to-one relationship and change the proportionality between the profiles to a different fold-extent for each metabolite in a sample. The metabolomic profile data is corrected from these biases to reduce the risk of assigning biological significance to changes due only to chemical kinetics. A data correction and validation strategy provides for a weighted average of metabolite derivatives after derivatization of an original metabolite and before steady state equilibrium is established between plural metabolite derivatives to maintain high-throughput data acquisition and metabolomics analysis.
(FR)Le profilage métabolomique d'un échantillon biologique au moyen d'un processus d'identification moléculaire par séparation tel que la chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse (GC-MS), nécessite la formation de dérivés de l'échantillon d'origine. La métabolomique GC-MS quantitative n'est possible que si le dérivé présente un rapport proportionnel de 1:1 avec le profil de concentration d'origine, la proportionnalité restant constante entre les échantillons. Deux types d'effets peuvent apparaître lors de la détermination d'un profil métabolomique et modifier ces conditions. Le premier type d'effet découle d'une modification de la grandeur de la proportionnalité entre les profils, et peut être corrigé à l'aide d'un étalon interne. Le second type d'effet peut fausser le rapport 1:1 et modifier la proportionnalité entre les profils à raison d'un facteur différent pour chaque métabolite de l'échantillon. Le procédé décrit permet de corriger le profil métabolomique afin de supprimer ces déviations et de réduire ainsi le risque d'attribuer une signification biologique à des modifications dues uniquement à la cinétique chimique. Il comprend un processus de correction et de validation de données permettant d'obtenir une moyenne pondérée des dérivés de métabolites après leur formation à partir du métabolite d'origine, et avant l'établissement d'un l'équilibre stable entre une pluralité de dérivés de métabolites, afin de maintenir un haut rendement d'acquisition des données et d'analyse métabolomique.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, LY, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)