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1. (WO2007007691) HOMOEOLOGOUS REGION JUDGING METHOD BY HOMO JUNCTION FINGERPRINT METHOD, HOMOEOLOGOUS REGION JUDGING DEVICE, AND GENE SCREENING METHOD
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2007/007691    International Application No.:    PCT/JP2006/313616
Publication Date: 18.01.2007 International Filing Date: 07.07.2006
Chapter 2 Demand Filed:    27.03.2007    
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), C12M 1/00 (2006.01), C12N 15/09 (2006.01), G06F 19/00 (2011.01), G06F 19/18 (2011.01), G06F 19/22 (2011.01)
Applicants: TOMY DIGITAL BIOLOGY CO., LTD. [JP/JP]; 3-14-17, Tagara, Nerima-ku, Tokyo 1790073 (JP) (For All Designated States Except US).
Saitama Medical University [JP/JP]; 38, Morohongo, Moroyama-machi, Iruma-gun, Saitama 3500495 (JP) (For All Designated States Except US).
HAGIWARA, Koichi [JP/JP]; (JP) (For US Only)
Inventors: HAGIWARA, Koichi; (JP)
Agent: KUDO, Ichiro; Yurakucho Denki Bldg. South Tower 7-1, Yurakucho 1-chome Chiyoda-ku Tokyo 1000006 (JP)
Priority Data:
2005-203654 12.07.2005 JP
Title (EN) HOMOEOLOGOUS REGION JUDGING METHOD BY HOMO JUNCTION FINGERPRINT METHOD, HOMOEOLOGOUS REGION JUDGING DEVICE, AND GENE SCREENING METHOD
(FR) PROCÉDÉ D’ÉVALUATION DE RÉGION HOMÉOLOGUE PAR PROCÉDÉ D’EMPREINTE DIGITALE À HOMOJONCTION, DISPOSITIF D’ÉVALUATION DE RÉGION HOMÉOLOGUE, ET PROCÉDÉ DE CRIBLAGE GÉNÉTIQUE
(JA) ホモ接合指紋法による同祖領域判定方法、同祖領域判定装置、及び遺伝子スクリーニング方法
Abstract: front page image
(EN)[PROBLEMS] To provide a method for efficiently searching for a recessive disease gene without needing any pedigree analysis. [MEANS FOR SOLVING PROBLEMS] In a homoeologous region judging method, the following steps are conducted. It is judged whether or not the base constituting a polymorphic marker of a sample DNA of diploid or higher polyploidy is a homojunction. Homojunction region information representing the region of the sample DNA where polymorphic markers judged as homojunctions continue is acquired. If the continuous probability and/or continuous distance of the polymorphic markers contained in the homojunction region information satisfy a predetermined judgment condition, the homojunction region is judged as a homoeologous region. A homoeologous region judging device and a gene screening method for identifying a disease susceptibility gene from the judged homoeologous region are also provided.
(FR)Le problème à résoudre dans le cadre de la présente invention consiste à proposer un procédé de recherche efficace d’un gène récessif de maladie ne nécessitant aucune analyse des antécédents. La solution proposée est de réaliser les étapes ci-dessous dans le cadre d’un procédé d’évaluation de région homéologue. On évalue si la base constituant un marqueur polymorphe d’un échantillon d’ADN présentant une diploïdie or une polyploïdie supérieure est une homojonction ou non. On acquiert des informations sur la région d’homojonction représentant la région de l’échantillon d’ADN où persistent des marqueurs polymorphes évalués comme étant des homojonctions. Si la probabilité continue et/ou la distance continue des marqueurs polymorphes contenus dans les informations de la région d’homojonction satisfont à une condition d’évaluation prédéterminée, la région d’homojonction est évaluée comme étant une région homéologue. L’invention concerne également un dispositif d’évaluation de région homéologue et un procédé de criblage génétique pour identifier un gène de susceptibilité de maladie à partir de la région évaluée comme étant homéologue.
(JA)【課題】本発明は、家系解析を必要としない効率的な劣性疾患遺伝子の探索方法を提供することにある。 【解決手段】二倍体以上である検体DNAの多型マーカーを構成している塩基がホモ接合であるか判定し、ホモ接合と判定された多型マーカーが連続する検体DNAの領域を示すホモ接合領域情報を取得し、前記ホモ接合領域情報に含まれる多型マーカーの連続確率及び/又は連続距離が所定の同祖判定条件を満たした場合に、ホモ接合体領域を同祖領域であると判定する同祖領域判定する同祖領域判定方法並びに同祖領域判定装置及び、判定された同祖領域から疾患感受性遺伝子を同定する遺伝子スクリーニング方法に関する。
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, LY, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: Japanese (JA)
Filing Language: Japanese (JA)