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1. (WO2007004643) MOLECULE SUPERIMPOSITION METHOD UTILIZED TOGETHER WITH THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE ACTIVITY CORRELATION METHOD
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2007/004643    International Application No.:    PCT/JP2006/313303
Publication Date: 11.01.2007 International Filing Date: 04.07.2006
IPC:
G06F 17/50 (2006.01), G06F 19/00 (2011.01)
Applicants: Nippon Zoki Pharmaceutical Co., Ltd. [JP/JP]; 1-2, Hirano-machi 2-chome, Chuo-ku, Osaka-shi, Osaka 5410046 (JP) (For All Designated States Except US).
KOTANI, Takayuki [JP/JP]; (JP) (For US Only).
HIGASHIURA, Kunihiko [JP/JP]; (JP) (For US Only)
Inventors: KOTANI, Takayuki; (JP).
HIGASHIURA, Kunihiko; (JP)
Agent: KAWAMIYA, Osamu; AOYAMA & PARTNERS, IMP Building 3-7, Shiromi 1-chome Chuo-ku, Osaka-shi Osaka 5400001 (JP)
Priority Data:
2005-195121 04.07.2005 JP
Title (EN) MOLECULE SUPERIMPOSITION METHOD UTILIZED TOGETHER WITH THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE ACTIVITY CORRELATION METHOD
(FR) PROCEDE DE SUPERPOSITION DE MOLECULES UTILISE AVEC UN PROCEDE DE CORRELATION D’ACTIVITE/STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE
(JA) 3次元構造活性相関法と共に利用される分子重ね合わせ方法
Abstract: front page image
(EN)This invention provides a molecule superimposition method in which, in a virtual space, three-dimensional structure data of a plurality of molecules are superimposed using structure activity correlation analysis as an index. The molecule superimposition method is characterized by comprising step A of conducting a first three-dimensional structural activity correlation analysis based on three-dimensional structure data for a group of molecules obtained by removing three-dimensional structure data for one molecule from an analysis object group of molecules to determine an index showing the quality of the model, step B of repeating step A for all the molecules, step C of rearranging indexes showing the quality of the model determined by the first three-dimensional structure activity correlation analysis obtained in step B to determine a molecule which most deteriorates the quality of the model, step D of conducting a second three-dimensional structure activity correlation analysis by successively varying three-dimensional structure data of molecular conformer determined in step C to determine a conformer to be selected, and step E of returning the step to step A until convergence conditions are satisfied.
(FR)La présente invention se rapporte à un procédé de superposition des molécules dans lequel, dans un espace virtuel, des données de structure tridimensionnelle d’une pluralité de molécules sont superposées à l’aide d’une analyse de corrélation d’activité/structure telle qu’un indice. Le procédé de superposition des molécules est caractérisé en ce qu’il contient une étape A consistant à mener de premières données de corrélation d’activité/structure fondées sur des données de structure tridimensionnelle pour un groupe de molécules obtenu en retirant des données de structure tridimensionnelle pour une molécule d’un groupe de molécules objet d’une analyse, afin de déterminer un indice montrant la qualité du modèle, une étape B consistant à répéter l’étape A pour toutes les molécules, une étape C consistant à réarranger les indices indiquant la qualité du modèle déterminé par la première analyse de corrélation d’activité/structure obtenue lors de l’étape B afin de déterminer une molécule qui détériore le plus la qualité du modèle, une étape D consistant à mener une seconde analyse de corrélation d’activité/structure tridimensionnelle en modifiant successivement les données de structure tridimensionnelle d’un conformateur moléculaire déterminé lors de l’étape C pour déterminer un conformateur devant être sélectionné, et une étape E consistant à revenir à l’étape A jusqu’à ce que les conditions de convergence soient remplies.
(JA) 仮想空間において、構造活性相関解析を指標として複数の分子の3次元構造データを重ね合わせる分子重ね合わせ方法であって、解析対象分子群から1つの分子の3次元構造データを取り除いた分子群で、3次元構造データによる第1の3次元構造活性相関解析を行いモデルの質を示す指標を求める工程Aと、すべての分子について工程Aを繰り返す工程Bと、工程Bで得られる第1の3次元構造活性相関解析よりモデルの質を示す指標を並べ替え、最もモデルの質を低下させている分子を求める工程Cと、工程Cで求めた分子のコンフォマーの3次元構造データを順次変化させて第2の3次元構造活性相関解析を行い、選択するコンフォマーを決定する工程Dと、収束条件を満たすまで工程Aに戻る工程Eとを含むことを特徴とする分子重ね合わせ方法を提供する。
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, LY, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: Japanese (JA)
Filing Language: Japanese (JA)