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1. (WO2007004479) DATA PROCESSOR
Latest bibliographic data on file with the International Bureau

Pub. No.: WO/2007/004479 International Application No.: PCT/JP2006/312858
Publication Date: 11.01.2007 International Filing Date: 28.06.2006
Chapter 2 Demand Filed: 27.03.2007
IPC:
G06F 19/00 (2006.01) ,G06F 17/30 (2006.01)
G PHYSICS
06
COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
F
ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
19
Digital computing or data processing equipment or methods, specially adapted for specific applications
G PHYSICS
06
COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
F
ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
17
Digital computing or data processing equipment or methods, specially adapted for specific functions
30
Information retrieval; Database structures therefor
Applicants:
国立大学法人京都大学 KYOTO UNIVERSITY [JP/JP]; 〒6068501 京都府京都市左京区吉田本町36番地1 Kyoto 36-1, Yoshida-honmachi, Sakyo-ku, Kyoto-shi, Kyoto 6068501, JP (AllExceptUS)
奥野恭史 OKUNO, Yasushi; null (UsOnly)
辻本豪三 TSUJIMOTO, Gozoh; null (UsOnly)
梁智允 YANG, Jiyoon; null (UsOnly)
種石慶 TANEISHI, Kei; null (UsOnly)
Inventors:
奥野恭史 OKUNO, Yasushi; null
辻本豪三 TSUJIMOTO, Gozoh; null
梁智允 YANG, Jiyoon; null
種石慶 TANEISHI, Kei; null
Agent:
特許業務法人池内・佐藤アンドパートナーズ IKEUCHI SATO & PARTNER PATENT ATTORNEYS; 〒5306026 大阪府大阪市北区天満橋1丁目8番30号OAPタワー26階 Osaka 26th Floor, OAP Tower 8-30, Tenmabashi 1-chome Kita-ku, Osaka-shi Osaka 530-6026, JP
Priority Data:
2005-19267530.06.2005JP
Title (EN) DATA PROCESSOR
(FR) PROCESSEUR DE DONNÉES
(JA) データ処理装置
Abstract:
(EN) A data processor concerning interaction between protein and compound applicable even to a compound of unknown activity or a protein of unknown function or unknown steric structure without basing on energy optimization employing empirical force field function. The data processor comprises a clustering section for clustering a profile or a kernel indicative of mutual distance of two or more known proteins and a profile or a kernel indicative of mutual distance of two or more known compounds, and a section for forming the distribution data of known interaction between the known protein and known compound based on the information of known interaction between the known protein and known compound according to the results of clustering of the known protein and known compound from the clustering section.
(FR) Processeur de données traitant l’interaction entre protéine et composé applicable même à un composé d’activité inconnue ou une protéine de fonction inconnue ou de structure stérique inconnue sans se baser sur l’optimisation de l’énergie employant une fonction empirique de champ de force. Le processeur de données comprend une section de mise en cluster pour mettre en cluster un profil ou un noyau indiquant une distance mutuelle de deux protéines connues ou plus et un profil ou un noyau indiquant une distance mutuelle de deux composés connus ou plus, et une section pour former les données de distribution d’une interaction connue entre la protéine connue et le composé connu basées sur l’information de l’interaction connue entre la protéine connue et le composé connu en fonction des résultats de la mise en cluster de la protéine connue et du composé connu de la section de mise en cluster.
(JA)  経験的力場関数を用いたエネルギー最適化を基礎とすることなく、活性未知な化合物や、機能未知または立体構造が未知であるタンパク質に対しても適用可能な、タンパク質と化合物との相互作用に関するデータ処理装置を提供する。2以上の既知タンパク質相互の距離を示すプロファイルもしくはカーネル、および、2以上の既知化合物相互の距離を示すプロファイルもしくはカーネルを、それぞれクラスタリングするクラスタリング処理部と、前記クラスタリング処理部による既知タンパク質のクラスタリング結果および既知化合物のクラスタリング結果に従って、前記既知タンパク質と既知化合物との既知相互作用の情報に基づき、前記既知タンパク質と既知化合物に対する前記既知相互作用の分布データを作成する分布データ作成部とを備えるデータ処理装置とする。
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African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Publication Language: Japanese (JA)
Filing Language: Japanese (JA)