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1. (WO2006088208) METHOD OF ESTIMATING PHYSIOLOGICAL CHANGE IN LIVING BODY AND APPARATUS TEHREFOR
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2006/088208    International Application No.:    PCT/JP2006/303083
Publication Date: 24.08.2006 International Filing Date: 21.02.2006
IPC:
C12N 15/09 (2006.01), G01N 33/53 (2006.01), G01N 37/00 (2006.01), G06F 19/20 (2011.01), G06Q 10/00 (2006.01), G06F 19/24 (2011.01)
Applicants: Dainippon Sumitomo Pharma Co., Ltd [JP/JP]; 6-8, Dosho-machi 2-chome, Chuo-ku, Osaka-shi, Osaka 5418524 (JP) (For All Designated States Except US).
NAGASAKA, Yosuke [JP/JP]; (JP) (For US Only).
TERAMOTO, Reiji [JP/JP]; (JP) (For US Only).
KIMURA, Toru [JP/JP]; (JP) (For US Only).
NAKAGAWA, Hiroyuki [JP/JP]; (JP) (For US Only).
ITO, Akira [JP/JP]; (JP) (For US Only).
EBISE, Hayao [JP/JP]; (JP) (For US Only).
GRAFF, Caroline [SE/SE]; (SE) (For US Only).
WINBLAD, Bengt [SE/SE]; (SE) (For US Only)
Inventors: NAGASAKA, Yosuke; (JP).
TERAMOTO, Reiji; (JP).
KIMURA, Toru; (JP).
NAKAGAWA, Hiroyuki; (JP).
ITO, Akira; (JP).
EBISE, Hayao; (JP).
GRAFF, Caroline; (SE).
WINBLAD, Bengt; (SE)
Agent: FURUTANI, Hideo; TEK No.2 Building, 23-20, Esaka-cho 1-chome, Suita-city Osaka 5640063 (JP)
Priority Data:
2005-044776 21.02.2005 JP
Title (EN) METHOD OF ESTIMATING PHYSIOLOGICAL CHANGE IN LIVING BODY AND APPARATUS TEHREFOR
(FR) PROCEDE D’EVALUATION D’UN CHANGEMENT PHYSIOLOGIQUE DANS UN CORPS VIVANT ET APPAREIL
(JA) 生体の生理的変化の予測方法および装置
Abstract: front page image
(EN)[PROBLEMS] By using, for example, a sample collected from a site differing from a site showing a physiological change in a living body, the physiological change is estimated at a high accuracy. [MEANS FOR SOLVING PROBLEMS] A vital tissue is collected from each of individuals belonging to a first living body group (a group of individuals showing a physiological change) and a second living body group (a group of individuals showing no change) (Step P2). In this step, the vital tissue is collected at a site different from a site that is estimated as showing the physiological change. Next, hybridization is conducted on DNA chips by using the samples collected from the individuals (Step P4). The hybridized DNA chips are scanned and the density data in each probe region are obtained as gene expression data (Step P5). Based on the gene expression data for each of the individuals obtained above, genes showing a remarkable difference in expression data between the first living body group and the second living body group are selected (Step P6). Multivariate analysis is made on the gene expression data of the marker genes of each of the individuals so as to establish the criteria for differentiating the first living body group from the second living body group.
(FR)Le problème à résoudre dans cette invention consiste en ce que, en utilisant, par exemple, un échantillon collecté à partir d’un site différent d’un site montrant un changement physiologique dans un corps vivant, le changement physiologique est évalué avec une précision élevée. Selon la solution proposée, un tissu vital est collecté à partir de chacun des individus appartenant à un premier groupe de corps vivants (un groupe d’individus montrant un changement physiologique) et un second groupe de corps vivants (un groupe d’individus ne montrant pas de changement) (Étape P2). Dans cette étape, le tissu vital est collecté au niveau d’un site différent d’un site que l’on a évalué comme montrant le changement physiologique. Ensuite, une hybridation est effectuée sur des puces à ADN en utilisant les échantillons collectés sur les individus (Étape P4). Les puces à ADN hybridées sont scannées et les données de densité dans chaque région de sonde sont obtenues en tant que données d’expression génique (Étape P5). Sur la base des données d’expression génique pour chacun des individus obtenues ci-dessus, les gènes montrant une différence remarquable des données d’expression entre le premier groupe de corps vivants et le second groupe de corps vivants sont sélectionnés (Étape P 6). Une analyse multivariable est réalisée sur les données d’expression génique des gènes marqueurs de chacun des individus de manière à établir les critères pour différencier le premier groupe de corps vivants du second groupe de corps vivants.
(JA)  【課題】 生体の生理的変化が生じる部位とは異なる部位から採取した試料などを用いて、当該生理的変化を高い精度で予測する。   【解決手段】 第1生体群(生理的変化を生じる個体)および第2生体群(生じない個体)に属する各個体から生体組織を採取する(ステップP2)。この際、生理的変化を予測する対象部位とは異なる部位の生体組織を採取する。次に、各個体から採取した試料を用いて、DNAチップによるハイブリダイゼーションを行う(ステップP4)。ハイブリダイゼーションしたDNAチップをスキャナで撮像し、各プローブ領域ごとの濃度データを遺伝子発現データとして取得する(ステップP5)。上記のようにして得た各個体ごとの遺伝子発現データに基づいて、第1生体群と第2生体群において顕著に発現データの異なる遺伝子を選抜する(ステップP6)。各個体におけるマーカー遺伝子群の遺伝子発現データについて多変量解析を行い、第1生体群と第2生体群を判別する基準を生成する。
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, LY, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: Japanese (JA)
Filing Language: Japanese (JA)