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1. (WO2006082685) METHOD FOR DETECTING SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2006/082685    International Application No.:    PCT/JP2005/022985
Publication Date: 10.08.2006 International Filing Date: 14.12.2005
Chapter 2 Demand Filed:    28.11.2006    
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), C12N 15/09 (2006.01), G01N 21/78 (2006.01)
Applicants: KYOTO UNIVERSITY [JP/JP]; 36-1, Yoshida-honmachi, Sakyo-ku, Kyoto-shi, Kyoto 6068501 (JP) (For All Designated States Except US).
NAKATANI, Kazuhiko; (For US Only).
SUDA, Hitoshi; (For US Only).
KOBORI, Akio; (For US Only)
Inventors: NAKATANI, Kazuhiko; .
SUDA, Hitoshi; .
KOBORI, Akio;
Agent: HOSODA, Yoshinori; c/o Hosoda International Patent Office, P.O. Box 26, OMM Building 5th Floor, 7-31, Otemae 1-chome, Chuo-ku, Osaka-shi, Osaka 5406591 (JP)
Priority Data:
2005-025644 01.02.2005 JP
Title (EN) METHOD FOR DETECTING SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM
(FR) PROCEDE DE DETECTION D’UN POLYMORPHISME NUCLEOTIDIQUE
(JA) 一塩基多型の検出方法
Abstract: front page image
(EN)A method for detecting a single nucleotide polymorphism characterized by mixing (A) I) a nucleic acid probe that can complementarily hybridize a nucleic acid to be evaluated having at least one single nucleotide polymorphism and has a nucleotide sequence with the addition of a cytosine residue or a thymine residue at a position adjacent to the 5’- or 3’-terminal side of a position pairing with the single nucleotide polymorphism, or II) a nucleic acid probe that can complementarily hybridize the antisense strand of a nucleic acid to be evaluated having at least one single nucleotide polymorphism and has a ucleotide sequence with the addition of a cytosine residue or a thymine residue at a position adjacent to the 5’- or 3’-terminal side of a position pairing with the single nucleotide polymorphism on the antisense strand, (B) a compound that can recognize a bulge base and (C) the nucleic acid to be evaluated, and detecting a signal based on the (B) compound that recognizes a cytosine bulge or a thymine bulge that is formed when the nucleic acid probe and the nucleic acid to be evaluated are hybridized to each other; and a kit for the method.
(FR)L’invention concerne un procédé de détection du polymorphisme nucléotidique caractérisé par le mélange de (A) I) une sonde d’acide nucléique qui peut s’hybrider de manière complémentaire à un acide nucléique devant être évalué présentant au moins un polymorphisme nucléotidique et qui présente une séquence nucléique en addition d’un résidu de cytosine ou de thymine à une position adjacente à l’extrémité terminale en 5’ ou 3’ d’une position s’appariant avec le polymorphisme nucléotidique ou II) une sonde d’acide nucléique s’hybridant de manière complémentaire au brin antisens d’un acide nucléique devant être évalué présentant au moins un polymorphisme nucléotidique et qui présente une séquence nucléique en addition d’un résidu de cytosine ou de thymine à une position adjacente à l’extrémité terminale en 5’ ou 3’ d’une position s’appariant avec le polymorphisme nucléotidique sur le brin antisens, (B) un composé qui peut reconnaître une base de renflement et (C) l’acide nucléique à évaluer, et un procédé de détection d’un signal s’appuyant sur le composé (B) qui reconnaît un renflement de cytosine ou de thymine qui est formé lorsque la sonde d’acide nucléique et l’acide nucléique devant être évalués s’hybride l’un à l’autre, et enfin, l’invention concerne un kit pour ce procédé.
(JA) 本発明は、(A)I)少なくとも一つの一塩基多型を含む評価対象核酸に対し相補的にハイブリダイズ可能であって、前記一塩基多型に対合する位置の5’若しくは3’末端側に隣接した位置にシトシン残基若しくはチミン残基が付加された塩基配列を有する核酸プローブ、又はII)少なくとも一つの一塩基多型を含む評価対象核酸のアンチセンス鎖に対し相補的にハイブリダイズ可能であって、前記アンチセンス鎖上の一塩基多型に対合する位置の5’若しくは3’末端側に隣接した位置にシトシン残基若しくはチミン残基が付加された塩基配列を有する核酸プローブ、と、(B)バルジ塩基認識可能な化合物と、(C)前記評価対象核酸と、を混合し、前記核酸プローブと評価対象核酸とがハイブリダイズした際に形成されるシトシンバルジ又はチミンバルジを認識する前記(B)の化合物に基づくシグナルを検出し、前記一塩基多型を評価することを特徴とする一塩基多型の検出方法、並びにそのキットを提供する。
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, LY, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: Japanese (JA)
Filing Language: Japanese (JA)