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1. (WO2006015991) IDENTIFICATION OF THE GENOTYPE OF THE HUMAN PAPILLOMAVIRUS WITH RESTRICTION ENZYME CVIRI
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2006/015991    International Application No.:    PCT/ES2004/000328
Publication Date: 16.02.2006 International Filing Date: 09.07.2004
IPC:
C12Q 1/70 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: SANTIAGO RUBIO, Enrique [ES/ES]; (ES)
Inventors: SANTIAGO RUBIO, Enrique; (ES)
Priority Data:
Title (EN) IDENTIFICATION OF THE GENOTYPE OF THE HUMAN PAPILLOMAVIRUS WITH RESTRICTION ENZYME CVIRI
(ES) IDENTIFICACIÓN DEL GENOTIPO DEL VIRUS DEL PAPILOMA HUMANO CON El ENZIMA DE RESTRICCIÓN CviRI.
(FR) IDENTIFICATION DU GENOTYPE DU PAPILLOMAVIRUS HUMAIN A L'AIDE DE L'ENZYME DE RESTRICTION CVIRI
Abstract: front page image
(EN)The invention relates to a method of identifying the genotype of the human papillomavirus (HPV) which causes genital infections. According to the invention, following amplification by PCR of a portion of region L1 of the HPV, which includes the segment defined by primers MY11/09, the method consists in treating the product of the amplification with restriction enzymes having the TGCA sequence of bases (enzyme CviRI and the isoschizomers thereof) as a cutting target. A comparison can be made between the sizes of the fragments obtained after cutting and the expected size standards of the known genotypes in order to identify the high-risk genotypes and most of the low-risk genotypes. There are two variants of the inventive method depending on whether the primers used in the pre-amplification are marked with a molecule which enables identification of the end fragments of the amplified segment.
(ES)Este descubrimiento consiste en un procedimiento para identificar el genotipo del virus del papiloma humano (HPV) causante de infecciones genitales. Partiendo de una amplificación previa por PCR de una porción de la región L1 del HPV que incluya el segmento definido por los primers MY11/09, el procedimiento consiste en el tratamiento del producto de la amplificación con enzimas de restricción que tienen como diana de corte la secuencia de bases TGCA (enzima CviRI y sus isosquizómeros). La comparación de los tamaños de los fragmentos obtenidos después del corte y los patrones de tamaños esperados de los genotipos conocidos permite la identificación de los genotipos de alto riesgo y de la mayoría de los de bajo riesgo. El procedimiento tiene dos variantes dependiendo de que los primers utilizados en la amplificación previa estén marcados con alguna molécula que permita la identificación de los fragmentos extremos del segmento amplificado.
(FR)L'invention concerne une méthode d'identification du génotype du papillomavirus humain (HPV) responsable des infections génitales. A partir d'une amplification préalable par PCR d'une partie de la région L1 du HPV comprenant le segment défini par les amorces MY11/09, la méthode consiste à traiter le produit de l'amplification à l'aide d'enzymes de restriction ayant comme cible de coupe la séquence de bases TGCA (enzyme CviRI et ses isoschisomères). La comparaison de la taille des fragments obtenus suite à la coupe et des patrons des tailles désirées des génotypes connus permet d'identifier des génotypes à haut risque et la majorité de ceux à moindre risque. Cette méthode présente deux variantes dépendant du marquage des amorces utilisées dans l'amplification préalable par une molécule permettant d'identifier les fragments d'extrémité du segment amplifié.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
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Publication Language: Spanish (ES)
Filing Language: Spanish (ES)