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Pub. No.:    WO/2005/123957    International Application No.:    PCT/US2005/020378
Publication Date: 29.12.2005 International Filing Date: 09.06.2005
C12Q 1/68 (2006.01), C07H 21/02 (2006.01), C07H 21/04 (2006.01)
Applicants: GE HEALTHCARE BIO-SCIENCES CORP. [US/US]; 800 Centennial Avenue, Piscataway, NJ 08854 (US) (For All Designated States Except US).
FULLER, Carl, W. [US/US]; (US) (For US Only).
NELSON, John, R. [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: FULLER, Carl, W.; (US).
NELSON, John, R.; (US)
Agent: JI, Yonggang; Amersham Biosciences Corp, 800 Centennial Avenue, Piscataway, NJ 08854 (US)
Priority Data:
60/578,789 10.06.2004 US
Abstract: front page image
(EN)This invention provides methods for nucleic acid analysis. A closed complex of nucleic acid template, nucleotide and polymerase can be formed during polymerase reaction, absent divalent metal ion. This is used to trap the labeled nucleotide complementary to the next template nucleotide in the closed complex. Detection of the label allows determination of the identity of this next correct nucleotide. Identification can be either in place, as part of the complex, or as the dye is eluted from the complex when the reaction cycle is completed by the addition of divalent metal ion. In this way, sequential nucleotides of a DNA can be identified, effectively determining the DNA sequence. This method can be applied to nucleic acid single molecules or to collections of identical or nearly identical sequence such as PCR products or clones. Multiple templates can be sequenced in parallel, particularly if they are immobilized on a solid support.
(FR)Cette invention concerne des procédés d'analyse d'acides nucléiques. Un complexe fermé de matrice d'acide nucléique, de nucléotide et de polymérase peut être formé pendant une réaction de la polymérase sans ion métallique divalent. Cette invention permet de piéger le nucléotide marqué complémentaire du nucléotide modèle suivant dans le complexe fermé. La détection de la marque permet de déterminer l'identité de ce nucléotide correct suivant. L'identification peut être effectuée sur place, dans le cadre du complexe, ou lorsque le colorant est élué à partir du complexe lorsque le cycle de réaction est achevé par l'ajout d'un ion métallique divalent. Ainsi, des nucléotides séquentiels d'un ADN peuvent être identifiés, ce qui permet de déterminer effectivement la séquence d'ADN. Ce procédé peut être appliqué à des molécules simples d'acide nucléique ou à des ensembles de séquences identiques ou quasi identiques tels que des produits de réaction en chaîne de la polymérase (PCR) ou des clones. De multiples matrices peuvent être séquencées en parallèle, en particulier si elles sont immobilisées sur un support solide.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)