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1. (WO2005118867) MICROFABRICATED INTEGRATED DNA ANALYSIS SYSTEM
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.: WO/2005/118867 International Application No.: PCT/US2005/018678
Publication Date: 15.12.2005 International Filing Date: 26.05.2005
IPC:
C12M 1/00 (2006.01) ,C12P 19/34 (2006.01)
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
M
APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY
1
Apparatus for enzymology or microbiology
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
P
FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
19
Preparation of compounds containing saccharide radicals
26
Preparation of nitrogen-containing carbohydrates
28
N-glycosides
30
Nucleotides
34
Polynucleotides, e.g. nucleic acids, oligoribonucleotides
Applicants: MATHIES, Richard, A.[US/US]; US (UsOnly)
BLAZEJ, Robert[US/US]; US (UsOnly)
LIU, Chung[CN/US]; US (UsOnly)
KUMARESAN, Palani[IN/US]; US (UsOnly)
YEUNG, Stephanie, H. I.[CN/US]; US (UsOnly)
THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF CALIFORNIA[US/US]; 1111 Franklin Street, 12th Floor Oakland, CA 94607-5200, US (AllExceptUS)
Inventors: MATHIES, Richard, A.; US
BLAZEJ, Robert; US
LIU, Chung; US
KUMARESAN, Palani; US
YEUNG, Stephanie, H. I.; US
Agent: AUSTIN, James E.; Beyer Weaver & Thomas, LLP P.O. BOX 70250 Oakland, CA 94612-0250, US
Priority Data:
11/139,01825.05.2005US
60/576,10201.06.2004US
Title (EN) MICROFABRICATED INTEGRATED DNA ANALYSIS SYSTEM
(FR) SYSTEME D'ANALYSE D'ADN INTEGRE, MICROFABRIQUE
Abstract:
(EN) Methods and apparatus for genome analysis are provided. A microfabricated structure including a microfluidic distribution channel is configured to distribute microreactor elements having copies of a sequencing template into a plurality of microfabricated thermal cycling chambers. A microreactor element may include a microcarrier element carrying the multiple copies of the sequencing template. The microcarrier element may comprise a microsphere. An autovalve at an exit port of a thermal cycling chamber, an optical scanner, or a timing arrangement may be used to ensure that only one microsphere will flow into one thermal cycling chamber wherein thermal cycling extension fragments are produced. The extension products are captured, purified, and concentrated in an integrated oligonucleotide gel capture chamber. A microfabricated component separation apparatus is used to analyze the purified extension fragments. The microfabricated structure may be used in a process for performing sequencing and other genetic analysis of DNA or RNA.
(FR) L'invention concerne des méthodes et un appareil d'analyse du génome. Une structure microfabriquée comprenant un canal de distribution microfluidique est configurée pour distribuer des éléments de microréacteur présentant des copies d'une matrice de séquençage dans une pluralité de chambres de cyclage thermique microfabriquées. Un élément de microréacteur peut comprendre un élément microporteur portant les multiples copies de la matrice de séquençage. L'élément microporteur peut comprendre une microsphère. Une soupape automatique placée au niveau d'un orifice de sortie d'une chambre de cyclage thermique, un scanneur optique, ou un arrangement de synchronisation peuvent être utilisés pour faire en sorte que seule une microsphère s'écoule dans une chambre de cyclage thermique où des fragments d'extension de cyclage thermique sont produits. Les produits d'extension sont capturés, purifiés et concentrés dans une chambre de capture par gel oligonucléotidique intégrée. Un appareil microfabriqué de séparation d'éléments est utilisé pour analyser les fragments d'extension purifiés. La structure microfabriquée peut être utilisée dans un procédé de séquençage et autre analyse génétique d'ADN ou d'ARN.
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Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)