WIPO logo
Mobile | Deutsch | Español | Français | 日本語 | 한국어 | Português | Русский | 中文 | العربية |
PATENTSCOPE

Search International and National Patent Collections
World Intellectual Property Organization
Search
 
Browse
 
Translate
 
Options
 
News
 
Login
 
Help
 
Machine translation
1. (WO2005114930) METHOD AND APPARATUS FOR IDENTIFYING PROTEINS IN MIXTURES
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2005/114930    International Application No.:    PCT/US2005/017742
Publication Date: 01.12.2005 International Filing Date: 20.05.2005
IPC:
H01J 49/00 (2006.01)
Applicants: WATERS INVESTMENTS LIMITED [US/US]; 109 Lukens Drive, New Castle, DE 19720 (US) (For All Designated States Except US).
GEROMANOS, Scott, J. [US/US]; (US) (For US Only).
GORENSTEIN, Marc, Victor [US/US]; (US) (For US Only).
SILVA, Jeffrey, Cruz [US/US]; (US) (For US Only).
LI, Guo-Zhong [CN/US]; (US) (For US Only)
Inventors: GEROMANOS, Scott, J.; (US).
GORENSTEIN, Marc, Victor; (US).
SILVA, Jeffrey, Cruz; (US).
LI, Guo-Zhong; (US)
Agent: GOTTS, Lawrence, J.; Pillsbury Winthrop Shaw Pittman LLP, 1650 Tysons Boulevard, McLean, VA 22102-4859 (US)
Priority Data:
60/572,532 20.05.2004 US
Title (EN) METHOD AND APPARATUS FOR IDENTIFYING PROTEINS IN MIXTURES
(FR) PROCEDE ET APPAREIL POUR IDENTIFIER DES PROTEINES DANS DES MELANGES
Abstract: front page image
(EN)A system and method for mass analysis where a sample (102) is separated in a liquid chromatograph (104), and subsequently analyzed in a mass spectrometer (112).
(FR)L'invention concerne une identification de protéines dans un échantillon de complexes comprenant la sélection d'une base de données présentant des protéines contenues dans l'échantillon. La digestion in silico est effectuée sur des protéines dans la base de données pour produire des peptides. Un peptide cible est sélectionné à partir des peptides sélectionnés. Les masses des fragments d'ions Y et B du peptide cible sont déterminés. Ainsi, une liste de masses est constituée. Ladite liste contient les ions Y, les ions B ainsi que la masse unique associée au précurseur non fragmenté. Lesdites masses sont utilisées pour rechercher des temps de rétention de masse convenables (AMRT) à énergie faible ou énergie élevée obtenus à partir d'une analyse LC/MS de l'échantillon complexe pour une masse ou toutes les masses contenues sur la liste. Chaque masse observée dans les données à l'intérieur d'un seuil de détection sont considérées comme une occurrence. Lorsque le nombre d'occurrences accumulées est suffisant sur une période de rétention donnée, le peptide cible est identifié comme étant dans l'échantillon. Des peptides dans la base de données détectent des peptides dans l'échantillon, dans le cas d'un recouvrement suffisant de la séquence. Du fait que l'identité de la séquence n'est pas nécessaire, les peptides modifiés peuvent être trouvés dans l'échantillon. La liste des peptides identifiés dans l'échantillon complexe peut être utilisée pour identifier les protéines présentes dans l'échantillon, pour suivre les temps de rétention chromatographiques des peptides entre les échantillons, et pour quantifier les peptides et les protéines présents dans les échantillons complexes.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)