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1. (WO2005103706) REAGENTS, DEVICES AND METHODS FOR PROTEOMIC ANALYSIS WITH APPLICATIONS INCLUDING DIAGNOSTICS AND VACCINES
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2005/103706    International Application No.:    PCT/CA2005/000606
Publication Date: 03.11.2005 International Filing Date: 19.04.2005
Chapter 2 Demand Filed:    01.02.2006    
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), G01N 33/48 (2006.01), G01N 33/50 (2006.01), G01N 33/543 (2006.01), G01N 33/68 (2006.01), G06F 17/18 (2006.01), G06F 19/00 (2006.01)
Applicants: NETWORK IMMUNOLOGY INC. [CA/CA]; 3311 Quesnel Drive, Vancouver, British Columbia V6S 1Z7 (CA) (For All Designated States Except US).
HOFFMANN, Geoffrey, William [AU/CA]; (CA) (For US Only)
Inventors: HOFFMANN, Geoffrey, William; (CA)
Agent: VERMETTE & Co.; Box 40, Granville Square, Suite 230-200 Granville Street, Vancouver, British Columbia V6C 1S4 (CA)
Priority Data:
60/563,819 21.04.2004 US
11/049,964 04.02.2005 US
Title (EN) REAGENTS, DEVICES AND METHODS FOR PROTEOMIC ANALYSIS WITH APPLICATIONS INCLUDING DIAGNOSTICS AND VACCINES
(FR) REACTIFS, DISPOSITIFS ET METHODES D'ANALYSE PROTEOMIQUE A L'AIDE D'APPLICATIONS COMPRENANT DES DIAGNOSTICS ET DES VACCINS
Abstract: front page image
(EN)The invention describes methods for proteomic analysis involving the mapping of samples in N-dimensional shape space. The applications include the classification of samples on the basis of the three-dimensional shapes of substances they contain. A panel of P (>>1) reagents, with P > N , called X(j), with j =1 to P, is used. The binding strength of each of the X(j) reagents to each other is a P x P matrix. This matrix is used to define another set of P reagents called Y(j), with j = 1 to P, each of which is a linear combination of the X(j) reagents and each of which is complementary to one of the X(j) reagents. N of the X(j) reagents together with the corresponding Y(j) reagents are used to define a shape space that has N approximately orthogonal axes. The definition of these axes facilitates classification of samples. Methods for measuring similarity between pairs of samples and between sets of samples in the context of the set of N reagent pairs X(j) and Y(j) with j = l to N are described. Applications include classification of samples, quality control, methods of diagnosis, and formulation of vaccines.
(FR)L'invention concerne des méthodes d'analyse protéomique impliquant la mise en correspondance d'échantillons dans un espace de forme N-dimensionnel. Les applications consistent à classifier des échantillons sur la base des formes tridimensionnelles des substances qu'ils contiennent. On utilise un échantillon permanent de P(>>1) réactifs avec P$m(G)N, appelé X(j) avec j =1 à P. La force de liaison de chacun des réactifs X(j) par rapport aux autres est représentée par une matrice P x P. On utilise cette matrice pour définir un autre ensemble de P réactifs appelé Y(j) avec j = 1 à P, chacun ensemble étant une combinaison linéaire des réactifs X(j) et chacun d'eux étant complémentaire de l'un des réactifs X(j). On utilise N des réactifs X(j) avec les réactifs Y(j) correspondant pour définir une forme spatiale qui comprend approximativement à N axes perpendiculaires. La définition de ces axes facilite la classification des échantillons. L'invention concerne également des méthodes permettant de mesurer une similarité entre des paires d'échantillons et entre des ensembles d'échantillons dans le contexte de l'ensemble de N paires de réactifs X(j) et Y(j) avec j = 1 à N. Les applications comprennent la classification des échantillons, le contrôle de qualité, des méthodes de diagnostic et des formulation de vaccins.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)