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1. (WO2005060641) ENGINEERED TEMPLATES AND THEIR USE IN SINGLE PRIMER AMPLIFICATION
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2005/060641    International Application No.:    PCT/US2004/041945
Publication Date: 07.07.2005 International Filing Date: 15.12.2004
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), C12P 19/34 (2006.01), C12N 15/11 (2006.01), C07K 16/00 (2006.01)
Applicants: ALEXION PHARMACEUTICALS, INC. [US/US]; 352 Knotter Drive, Cheshire, CT 06410 (US) (For All Designated States Except US).
MARUYAMA, Toshiaki [JP/US]; (US) (For US Only).
FREDERICKSON, Shana [US/US]; (US) (For US Only).
BOWDISH, Katherine, S. [US/US]; (US) (For US Only).
RENSHAW, Mark [US/US]; (US) (For US Only).
LIN, Ying-Chi [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: MARUYAMA, Toshiaki; (US).
FREDERICKSON, Shana; (US).
BOWDISH, Katherine, S.; (US).
RENSHAW, Mark; (US).
LIN, Ying-Chi; (US)
Agent: FISH & NEAVE IP GROUP OF ROPES & GRAY; One International Place,, Boston, MA 02110, (US)
Priority Data:
10/737,252 15.12.2003 US
60/323,455 19.09.2001 US (Priority Withdrawn 24.02.2005)
10/251,085 19.09.2002 US (Priority Withdrawn 24.02.2005)
Title (EN) ENGINEERED TEMPLATES AND THEIR USE IN SINGLE PRIMER AMPLIFICATION
(FR) MATRICES ARTIFICIELLES ET LEUR UTILISATION DANS L'AMPLIFICATION PAR AMORCE UNIQUE
Abstract: front page image
(EN)Methods of amplifying nucleic acid have now been discovered which include the steps of: a) annealing a primer to a template nucleic acid sequence, the primer having a first portion which anneals to the template and a second portion of predetermined sequence; b) synthesizing a polynucleotide that anneals to and is complementary to the portion of the template between the location at which the first portion of the primer anneals to the template and the end of the template, the polynucleotide having a first end and a second end, wherein the first end incorporates the primer; c) separating the polynucleotide synthesized in step (b) from the template; d) annealing a nested oligonucleotide to the second end of the polynucleotide synthesized in step (b), the nested oligonucleotide having a first portion that anneals to the second end of the polynucleotide and a second portion having the same predetermined sequence as the second portion of the primer; e) extending the polynucleotide synthesized in step (b) to provide a terminal portion thereof that is complementary to the predetermined sequence; and f) amplifying the extended polynucleotide using a single primer having the predetermined sequence. In particularly useful embodiments, the methods are used to amplify a repertoire of IgA antibodies.
(FR)Selon l'invention, on a découvert des méthodes d'amplification d'un acide nucléique consistant (a) à hybrider une amorce à une séquence d'acide nucléique de matrice, cette amorce comprenant une première partie s'hybridant à la matrice et une seconde partie de séquence prédéterminée, (b) à synthétiser un polynucléotide qui s'hybride à une partie de la matrice et qui en est complémentaire, cette partie se trouvant entre l'emplacement où la première partie de l'amorce s'hybride à la matrice et l'extrémité de la matrice, le polynucléotide possédant une première extrémité et une seconde extrémité, la première extrémité comportant l'amorce, (c) à séparer le polynucléotide synthétisé dans l'étape (b) de la matrice, (d) à hybrider un oligonucléotide niché à la seconde extrémité du polynucléotide synthétisé dans l'étape (b), l'oligonucléotide niché possédant une première partie s'hybridant à la seconde extrémité du polynucléotide et une seconde partie comprenant la même séquence prédéterminée que la seconde partie de l'amorce, (e) à étendre le polynucléotide synthétisé dans l'étape (b) en vue de l'obtention d'une partie terminale correspondante complémentaire de la séquence prédéterminée, et (f) à amplifier le polynucléotide étendu au moyen d'une amorce unique comprenant la séquence prédéterminée. Dans des modes de réalisation particulièrement utiles, ces méthodes sont utilisées pour amplifier un répertoire d'anticorps IgA.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)