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1. (WO2005036369) DATABASE FOR MICROBIAL INVESTIGATIONS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau

Pub. No.: WO/2005/036369 International Application No.: PCT/US2004/033742
Publication Date: 21.04.2005 International Filing Date: 12.10.2004
IPC:
G01N 33/48 (2006.01) ,G06F 19/00 (2011.01)
G PHYSICS
01
MEASURING; TESTING
N
INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
33
Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/-G01N31/131
48
Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
G PHYSICS
06
COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
F
ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
19
Digital computing or data processing equipment or methods, specially adapted for specific applications
Applicants:
ISIS PHARMACEUTICALS, INC. [US/US]; 1896 Rutherford Road Carlsbad, CA 92008, US (AllExceptUS)
HARI, Kumar; null (UsOnly)
MCNEIL, John [US/US]; US (UsOnly)
ECKER, Dave [US/US]; US (UsOnly)
WHITE, Neill; US (UsOnly)
SAMANT, Vivek [US/US]; US (UsOnly)
ZAPP, Vanessa; null (UsOnly)
GOATES, Alan [US/US]; US (UsOnly)
Inventors:
HARI, Kumar; null
MCNEIL, John; US
ECKER, Dave; US
WHITE, Neill; US
SAMANT, Vivek; US
ZAPP, Vanessa; null
GOATES, Alan; US
Agent:
BROWNSTONE, Daniel, R. ; Fenwick & West LLP 801 California Street Mountain View, CA 94041, US
Priority Data:
60/509,91109.10.2003US
60/598,40802.08.2004US
Title (EN) DATABASE FOR MICROBIAL INVESTIGATIONS
(FR) BASE DE DONNEES POUR INVESTIGATIONS MICROBIENNES
Abstract:
(EN) A centralized system provides for locating, storing and providing microbial-related information, including pathogens, diseases, symptoms, genetic information, and related documentation. A centralized database relates pathogens to diseases that they cause, symptoms of those diseases, genetic information about the pathogens, and documentation that is associated with any of the above. By analyzing the stored data, the system recognizes duplicated information, for example a pathogen present in the database twice, each time under a different taxonomical name, and creates a link from one instance of the pathogen to the other. The system additionally identifies common genes and sequences among related organisms. A researcher uses the system to perform investigations. For example, a medical doctor can enter patient symptoms to obtain a list of consistent diseases and associated pathogens. The system also tracks the progression of an outbreak and identifies similar occurrences by searching the World Wide Web and reporting results.
(FR) La présente invention concerne un système centralisé permettant la localisation, l'enregistrement et la mise à disposition d'informations relatives aux microbes, comprenant des agents pathogènes, des maladies, des symptômes, des informations génétiques et de la documentation associée. Une base de données centralisée met en relation des agents pathogènes et des maladies qu'ils provoquent, des symptômes de ces maladies, des informations génétiques relatives à ces agents pathogènes, et de la documentation qui est associée à l'un quelconque des éléments mentionnés précédemment. L'analyse des données enregistrées permet au système de reconnaître des informations dupliquées, par exemple un agent pathogène présent deux fois dans la base de données, chaque fois sous un nom taxonomique différent, et de créer un lien d'une occurrence de l'agent pathogène à l'autre. De plus, le système identifie des gènes communs et des séquences communes parmi des organismes mis en relation. Un chercheur se sert du système pour réaliser des investigations. Par exemple, un médecin peut saisir des symptômes dont souffre un patient pour obtenir une liste de maladies correspondantes et d'agents pathogènes associés. Le système effectue également le suivi de la progression d'une épidémie et identifie les occurrences similaires grâce à la recherche sur le web et au report des résultats obtenus.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW
African Regional Intellectual Property Organization (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IT, LU, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)