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1. (WO2005010677) CHARACTERIZING BIOLOGICAL STIMULI BY RESPONSE CURVES
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2005/010677    International Application No.:    PCT/US2004/022519
Publication Date: 03.02.2005 International Filing Date: 16.07.2004
IPC:
G06K 9/00 (2006.01), G01N 33/48 (2006.01)
Applicants: CYTOKINETICS, INC. [US/US]; 280 East Grand Avenue, South San Francisco, CA 94080 (US) (For All Designated States Except US).
KUTSYY, Vadim [US/US]; (US) (For US Only).
COLEMAN, Daniel, A. [US/US]; (US) (For US Only).
VAISBERG, Eugeni, A. [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: KUTSYY, Vadim; (US).
COLEMAN, Daniel, A.; (US).
VAISBERG, Eugeni, A.; (US)
Agent: GARRETT, Arthur, S.; Finnegan, Henderson, Farabow, Garrett & Dunner, L., L.P., 1300 I Street, N.W., Washington, D.C. 20005-3315 (US)
Priority Data:
60/509,040 18.07.2003 US
Title (EN) CHARACTERIZING BIOLOGICAL STIMULI BY RESPONSE CURVES
(FR) CARACTERISATION DE STIMULI BIOLOGIQUES PAR COURBES DE REPONSE
Abstract: front page image
(EN)A method for calculating distances between stimulus response curves (e.g., dose response curves) allows classification of stimuli, The response curves show how the phenotype of one or more cells changes in response to varying levels of the stimulus. Each “point” on the curve represents quantitative phenotype or signature for cell(s) at a particular level of stimulus (e.g., dose of a therapeutic). The signatures are multivariate phenotypic representations of the cell (s). They include various features of the cell(s) obtained by image analysis. To facilitate the comparison of stimuli, distances between points on the response curves are calculated. First, the response curves may be aligned on a coordinate representing a separate distance, r, from a common point of negative control (e.g., the point where no stimulus is applied). Integration on r may be used to compute the distance between two response curves. The distance between response curves is used to classify stimuli.
(FR)L'invention concerne un procédé de calcul de distances entre des courbes de réponse à des stimuli (par exemple, courbes de réponse à une dose) qui permet de classifier des stimuli. Les courbes de réponse montrent la façon dont le phénotype d'une ou de plusieurs cellules change en réponse à des niveaux variables du stimulus. Chaque «point» sur la courbe représente un phénotype quantitatif ou une signature pour des cellules à un niveau particulier de stimulus (par exemple, dose d'un médicament). Les signatures sont des représentations phénotypiques multivariables de la ou des cellule(s). Elles comprennent des caractéristiques diverses de la ou des cellule(s) obtenues par analyse d'image. Afin de faciliter la comparaison des stimuli, les distances entre les points des courbes de réponse sont calculées. Tout d'abord, les courbes de réponse peuvent être alignées sur une coordonnée représentant une distance séparée, r, d'un point commun de commande négative (par exemple, le point sur lequel aucun stimulus n'est appliqué). L'intégration sur r peut être utilisée pour calculer la distance entre deux courbes de réponse. La distance entre des courbes de réponse sert à classifier les stimuli.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
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European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IT, LU, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)