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1. (WO2005010145) METHOD AND COMPOSITIONS FOR DETECTION AND ENUMERATION OF GENETIC VARIATIONS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2005/010145    International Application No.:    PCT/US2004/015587
Publication Date: 03.02.2005 International Filing Date: 09.06.2004
IPC:
C07H 21/04 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: THE JOHNS HOPKINS UNIVERSITY [US/US]; 3400 N. Charles Street, Baltimore, MD 21218 (US) (For All Designated States Except US).
DRESSMAN, Devin [US/US]; (US) (For US Only).
YAN, Hai [CN/US]; (US) (For US Only).
KINZLER, Kenneth, W. [US/US]; (US) (For US Only).
VOGELSTEIN, Bert [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: DRESSMAN, Devin; (US).
YAN, Hai; (US).
KINZLER, Kenneth, W.; (US).
VOGELSTEIN, Bert; (US)
Agent: KAGAN, Sarah, A.; Banner & Witcoff, Ltd., 11th Floor, 1001 G Street, N.W., Washington, DC 20001-4597 (US)
Priority Data:
60/485,301 05.07.2003 US
60/525,859 01.12.2003 US
Title (EN) METHOD AND COMPOSITIONS FOR DETECTION AND ENUMERATION OF GENETIC VARIATIONS
(FR) PROCEDE ET COMPOSITIONS DE DETECTION ET D'ENUMERATION DE VARIATIONS GENETIQUES
Abstract: front page image
(EN)Many areas of biomedical research depend on the analysis of uncommon variations in individual genes or transcripts. Here we describe a method that can quantify such variation at a scale and ease heretofore unattainable. Each DNA molecule in a collection of such molecules is converted into a single particle to which thousands of copies of DNA identical in sequence to the original are bound. This population of beads then corresponds to a one-to-one representation of the starting DNA molecules. Variation within the original population of DNA molecules can then be simply assessed by counting fluorescently-labeled particles via flow cytometry. Millions of individual DNA molecules can be assessed in this fashion with standard laboratory equipment. Moreover, specific variants can be isolated by flow sorting and employed for further experimentation. This approach can be used for the identification and quantification of rare mutations as well as to study variations in gene sequences or transcripts in specific populations or tissues.
(FR)De nombreux domaines de la recherche biomédicale dépendent de l'analyse de variations peu communes dans des gènes individuels ou des transcrits. L'invention concerne un procédé permettant de quantifier une telle variation à une échelle et avec une facilité jamais atteintes auparavant. Chaque molécule d'ADN dans un ensemble de telles molécules est convertie en une particule unique à laquelle sont liés des milliers de copies d'ADN identique en séquence à l'original. Cette population de billes correspond ensuite à une représentation individuelle des molécules d'ADN de départ. Une variation dans la population d'origine des molécules d'ADN peut être évaluée simplement par décompte des particules étiquetées en fluorescence au moyen de la cytométrie en flux. Des millions de molécules d'ADN individuelles peuvent être évaluées de cette manière au moyen d'un équipement de laboratoire conventionnel. Plus précisément, des variants spécifiques peuvent être isolés au moyen de la cytofluorométrie de flux et mis en oeuvre aux fins d'expérience ultérieure. Cette approche peut être utilisée pour l'identification et la quantification de mutations rares, ainsi que pour l'étude de variations dans des séquences ou des transcrits de gènes dans des populations ou tissus spécifiques.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IT, LU, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)