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1. (WO2004036179) HIGH THROUGHPUT DETECTION OF GLUTATHIONE S-TRANSFERASE POLYMORPHIC ALLELES
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2004/036179    International Application No.:    PCT/US2003/032765
Publication Date: 29.04.2004 International Filing Date: 15.10.2003
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: UNIVERSITY OF UTAH RESEARCH FOUNDATION [US/US]; 615 Arapeen Drive, Suite 110, Salt Lake City, UT 84108 (US) (For All Designated States Except US).
KELLER, Charles [US/US]; (US) (For US Only).
BALLARD, Linda [US/US]; (US) (For US Only).
LEMMONS, Richard [US/US]; (US) (For US Only).
ALI-OSMAN, Francis [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: KELLER, Charles; (US).
BALLARD, Linda; (US).
LEMMONS, Richard; (US).
ALI-OSMAN, Francis; (US)
Agent: HULSE, Loren, R.; Madson & Metcalf, 15 West South Temple, Suite 900, Salt Lake City, UT 84101 (US)
Priority Data:
60/418,876 15.10.2002 US
Title (EN) HIGH THROUGHPUT DETECTION OF GLUTATHIONE S-TRANSFERASE POLYMORPHIC ALLELES
(FR) DETECTION A HAUT DEBIT D'ALLELES POLYMORPHES DE GLUTATHION-S-TRANSFERASE
Abstract: front page image
(EN)High throughput assays for detecting glutathione S-transferase polymorphic alleles are disclosed. The assays of the invention utilize a biological sample obtained from a patient. Genomic DNA is obtained from the biological sample. A portion of the DNA is amplified using PCR to detect GSTM1 alleles, a second portion of the DNA is amplified to detect GSTM3 and GSTT1 alleles, and another portion of the DNA is amplified to detect GSTP1 alleles. The PCR amplification products may then be combined, and the glutathione S-transferase polymorphic alleles may be detected based on PCR amplification product size differences and fluorescent tag differences. The assays of the invention are designed for high throughput use such as in large clinical trials. The assay generally circumvents the use of restriction endonucleases, while allowing all analyses to be performed simultaneously. In addition, the assay permits detection of all four clinically-significant GST polymorphic alleles.
(FR)L'invention concerne des tests à haut débit pour détecter des allèles polymorphes de glutathion-S-transférase. Ces tests consistent à obtenir un échantillon biologique auprès d'un patient, à isoler de l'ADN génomique de cet échantillon, à amplifier une partie de cet ADN par PCR pour détecter des allèles GSTM1, à amplifier une deuxième partie de cet ADN pour détecter des allèles GSTM3 et GSTT1, puis à amplifier une autre partie de cet ADN pour détecter des allèles GSTP1. Les produits d'amplification PCR peuvent ensuite être associés et les allèles polymorphes de glutathion-S-transférase peuvent être détectés d'après les différences de taille de ces produits d'amplification PCR et les différences d'étiquette fluorescente. Les tests selon l'invention sont destinés à une utilisation à haut débit, notamment dans le cadre d'essais cliniques à grande échelle. Ces tests permettent de manière générale d'éliminer la nécessité de recourir à des endonucléases de restriction, tout en permettant d'effectuer toutes les analyses simultanément. Ces tests permettent par ailleurs de détecter les quatre allèles polymorphes GST présentant un intérêt clinique.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NI, NO, NZ, OM, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (GH, GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IT, LU, MC, NL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)