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1. (WO2004022721) QUANTIFICATION OF GENE EXPRESSION
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Pub. No.: WO/2004/022721 International Application No.: PCT/US2003/028081
Publication Date: 18.03.2004 International Filing Date: 05.09.2003
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Q
MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1
Measuring or testing processes involving enzymes or micro-organisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68
involving nucleic acids
Applicants:
THE TRUSTEES OF BOSTON UNIVERSITY [US/US]; One Sherborn Street Boston, MA 02218, US (AllExceptUS)
CANTOR, Charles, R. [US/US]; US (UsOnly)
DING, Chunming [CN/US]; US (UsOnly)
Inventors:
CANTOR, Charles, R.; US
DING, Chunming; US
Agent:
EISENSTEIN, Ronald, I. ; Nixon Peabody LLP 101 Federal Street Boston, MA 02110, US
Priority Data:
60/408,81906.09.2002US
60/422,03029.10.2002US
Title (EN) QUANTIFICATION OF GENE EXPRESSION
(FR) QUANTIFICATION DE L'EXPRESSION GENETIQUE
Abstract:
(EN) The present invention relates to a method for measuring the amount of a target nucleic acid in a sample using a standard which is designed to have one base difference compared with the gene of interest or a 'target nucleic acid sequence.' Use of such standard in combination with a method of 'enhancing' the difference in the standard and the test nucleic acid sample using, for example, a base extension reaction carried right at the mutation site allowing amplification of the standard and target nucleic acids with the same efficiency and facilitating quantification of the target nucleic acid. Thereafter a means of quantifying the 'enhanced' standard and target nucleic acid samples is used to determine the amount of the target nucleic acid. In the preferred embodiment, the quantification means is Mass Spectrometry.
(FR) L'invention concerne un procédé permettant de mesurer la quantité d'un acide nucléique cible dans un échantillon au moyen d'un étalon qui est conçu de manière à présenter une différence de base, comparée avec le gène considéré ou une « séquence acide nucléique cible ». L'utilisation d'un tel étalon, en combinaison avec un procédé d' « accroissement » de la différence dans l'étalon et l'échantillon d'acide nucléique à tester, au moyen, par exemple, d'une réaction d'extension de base effectuée directement sur le site de mutation, permet l'amplification de l'étalon et des acides nucléiques cibles avec la même efficacité et facilite la quantification de l'acide nucléique cible. De la sorte, un moyen de quantification de l'étalon « augmenté » et des échantillons d'acide nucléique cible est utilisé pour déterminer la quantité de l'acide nucléique cible. Selon une forme d'exécution préférée, le moyen de quantification est la spectrométrie de masse.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW
African Regional Intellectual Property Organization (ARIPO) (GH, GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IT, LU, MC, NL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)
Also published as:
EP1546385JP2005537804CN1703521CA2497988AU2003270397IN318/CHENP/2005