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1. (WO2003058205) METHODS OF IDENTIFYING PUTATIVE EFFECTOR PROTEINS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2003/058205    International Application No.:    PCT/US2003/000911
Publication Date: 17.07.2003 International Filing Date: 13.01.2003
IPC:
G01N 33/68 (2006.01)
Applicants: CORNELL RESEARCH FOUNDATION, INC. [US/US]; 20 Thornwood Drive, Suite 105, Ithaca, NY 14580 (US).
THE BOARD OF REGENTS OF THE UNIVERSITY OF NEBRASKA [US/US]; Varner Hall, 3835 Holdrege Street, Lincoln, NE 685833 (US).
UNITED STATES DEPARTMENT OF AGRICULTURE [US/US]; ARS Office of Technology Transfer, 5601 Sunnyside Avenue - Room 4-1188, Beltsville, MD 20705 (US)
Inventors: COLLMER, Alan; (US).
ALFANO, James; (US).
SCHNEIDER, David; (US).
SCHECHTER, Lisa; (US)
Agent: GOLDMAN, Michael, L.; Nixon Peabody LLP, Clinton Square, P.O. Box 31051, Rochester, NY 14603-1051 (US)
Priority Data:
60/348,061 11.01.2002 US
Title (EN) METHODS OF IDENTIFYING PUTATIVE EFFECTOR PROTEINS
(FR) PROCEDE D'IDENTIFICATION DE PROTEINES EFFECTRICES HYPOTHETIQUES
Abstract: front page image
(EN)A system and method for identifying putative effector proteins that includes providing a predicted amino acid sequence and determining whether the predicted amino acid sequence satisfies one or more rules from a set of rules that applies to known effector protein amino acid sequences, wherein satisfaction of the one or more rules indicates that the predicted amino acid sequence is likely an effector protein. A computer readable medium is also disclosed herein as having stored thereon instructions which, when executed by a processor, cause the processor to perform such a determination.
(FR)L'invention concerne un système et un procédé d'identification de protéines effectrices hypothétiques consistant à présenter une séquence prédite d'acides aminés et à déterminer si cette séquence satisfait à l'une, ou à plusieurs règles parmi un ensemble de règles, qui s'applique aux séquences d'acides aminés de protéines effectrices connues, la vérification que la séquence obéit à l'une, ou à plusieurs de ces règles, indiquant que la séquence prédite est vraisemblablement celle d'une protéine effectrice. L'invention concerne aussi un support lisible par informatique contenant des instructions stockées qui, lorsqu'elles sont exécutées par un processeur, permettent au processeur de réaliser une telle détermination.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NI, NO, NZ, OM, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (GH, GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)