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1. (WO2003054774) LANGUAGE FOR NETWORKS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2003/054774    International Application No.:    PCT/US2002/035445
Publication Date: 03.07.2003 International Filing Date: 04.11.2002
IPC:
G06F 17/27 (2006.01)
Applicants: GENE NETWORK SCIENCES, INC. [US/US]; 2359 N. Triphammer Road Ithaca, NY 14850 (US)
Inventors: MAIMON, Ron; (US)
Agent: LEWKOWICZ, Paul, E.; Ropes & Gray One International Place Boston, MA 02110-2624 (US)
Priority Data:
60/335,333 02.11.2001 US
Title (EN) LANGUAGE FOR NETWORKS
(FR) LANGAGE POUR RESEAUX
Abstract: front page image
(EN)Presently described is a formal language for describing the function of biochemical networks. Because it is a language, it includes a method of parsing, or understanding the language, which is a highly complex recursive algorithm. This formal language, the Cell language, is described both informally, so that it may be written, and formally, so that it may be parsed. The Cell Language makes it possible to model all the interactions in a cell in a single diagram, with only a few representations of each molecule. (Fig. 3) The notation is compact and modular, in the sense that complex interactions composed of many subparts may be annotated with the same symbols as the simplest interactions composed of individual molecules or genes.
(FR)L'invention concerne un langage formel utilisé pour décrire la fonction de réseaux biochimiques. Du fait qu'il s'agit d'un langage, il met en oeuvre un procédé d'analyse et de compréhension dudit langage constitué d'un algorithme récursif très complexe. Ce langage formel appelé langage cellulaire est décrit à la fois de manière informelle de sorte qu'il peut être écrit, et de manière formelle de sorte qu'il peut être analysé. Ce langage cellulaire permet de modéliser toutes les interactions intervenant dans une cellule dans un seul schéma uniquement à l'aide de quelques représentations de chaque molécule. La notation est compacte et modulaire, dans le sens où des interactions complexes composées de plusieurs sous-parties peuvent être annotées avec les mêmes symboles que les interactions les plus simples composées de molécules ou de gènes individuels.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NO, NZ, OM, PH, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, UZ, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (GH, GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)