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1. (WO2003054770) A METHOD OF CLUSTERING TRANSMEMBRANE PROTEINS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2003/054770    International Application No.:    PCT/EP2002/014868
Publication Date: 03.07.2003 International Filing Date: 20.12.2002
Chapter 2 Demand Filed:    19.05.2003    
IPC:
G01N 33/48 (2006.01), G01N 33/50 (2006.01), G01N 33/53 (2006.01), G06F 19/22 (2011.01), G06F 19/16 (2011.01), G06F 19/18 (2011.01), G06F 19/24 (2011.01)
Applicants: JANSSEN PHARMACEUTICA N.V. [BE/BE]; Turnhoutseweg 30, B-2340 Beerse (BE) (For All Designated States Except US).
VAN DER SPEK, Petrus, Johannes [NL/BE]; (BE) (For US Only).
VAN NIMWEGEN, Maroesja, Maria, Jannetje [NL/NL]; (NL) (For US Only).
NEEFS, Jean-Marc, Edmond, Fernand, Marie [BE/BE]; (BE) (For US Only)
Inventors: VAN DER SPEK, Petrus, Johannes; (BE).
VAN NIMWEGEN, Maroesja, Maria, Jannetje; (NL).
NEEFS, Jean-Marc, Edmond, Fernand, Marie; (BE)
Agent: DE CORTE, Filip; Janssen Pharmaceutica N.V., Patent Department, Turnhoutseweg 30, B-2340 Beerse (BE)
Priority Data:
01205090.2 21.12.2001 EP
Title (EN) A METHOD OF CLUSTERING TRANSMEMBRANE PROTEINS
(FR) METHODE DE GROUPEMENT EN MASSE DE PROTEINES TRANSMEMBRANAIRES
Abstract: front page image
(EN)A method and apparatus for clustering polypeptide sequences, and in particular transmembrane proteins, is disclosed. Intra-membrane regions are isolated and the amino acid labels replaced with one or more physical/chemical parameters. The resulting data vectors are analysed using a clustering technique based on correlation between the data vectors, for example using aglomerative hierarchical clustering.
(FR)L'invention concerne un procédé et un appareil de groupement en masse de séquences polypeptidiques, et notamment de protéines transmembranaires. Les zones intra-membranes sont isolées et les étiquettes d'acides aminés sont remplacées par un ou plusieurs paramètres physiques/chimiques. Les vecteurs de données résultants sont analysés par une technique de groupement en masse, en fonction de la corrélation entre les vecteurs de données, par exemple au moyen du groupement en masse hiérarchique d'agglomération.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NO, NZ, OM, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (GH, GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE, SI, SK, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)