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1. (WO2002031203) HIGH THROUGHPUT OR CAPILLARY-BASED SCREENING FOR A BIOACTIVITY OR BIOMOLECULE
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Pub. No.: WO/2002/031203 International Application No.: PCT/US2001/031806
Publication Date: 18.04.2002 International Filing Date: 10.10.2001
Chapter 2 Demand Filed: 09.05.2002
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Q
MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1
Measuring or testing processes involving enzymes or micro-organisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68
involving nucleic acids
Applicants:
SHORT, Jay, M. [US/US]; US (UsOnly)
KELLER, Martin [US/US]; US (UsOnly)
LAFFERTY, William, Michael [US/US]; US (UsOnly)
DIVERSA CORPORATION [US/US]; 4955 Directors Place San Diego, CA 92121, US (AllExceptUS)
Inventors:
SHORT, Jay, M.; US
KELLER, Martin; US
LAFFERTY, William, Michael; US
Agent:
HAILE, Lisa, A.; Gary Cary Ware & Friedenrich LLP Suite 1100 4365 Executive Drive San Diego, CA 92121-2133, US
Priority Data:
09/685,43210.10.2000US
09/738,87115.12.2000US
09/790,32121.02.2001US
09/894,95627.06.2001US
60/309,10131.07.2001US
Title (EN) HIGH THROUGHPUT OR CAPILLARY-BASED SCREENING FOR A BIOACTIVITY OR BIOMOLECULE
(FR) CRIBLAGE A HAUT RENDEMENT OU DE TYPE CAPILLAIRE DESTINE A IDENTIFIER UNE BIO-ACTIVITE OU UNE BIOMOLECULE
Abstract:
(EN) Provided is a method of screening or enriching a sample containing polynucleotides from a mixed population of organisms. The method includes creating a DNA library from a plurality of nucleic acid sequences of a mixed population of organisms and separating clones containing a polynucleotide sequence of interest on an analyzer detects a detectable molecule on a probe or bioactive substrate. The analyzer includes FACS devices, SQUID devices and MSC devices. The separated or enrich library can then be further process by activity based screening or sequence based screening. In addition, the enriched sequence can be compared to a database and to identify sequences in the database which have homology to a clone in the library thereby obtaining a nucleic acid profile of the mixed population of organisms.
(FR) L'invention concerne une méthode de criblage ou d'enrichissement d'un échantillon contenant des polynucléotides provenant d'une population mixte d'organismes. La méthode consiste à créer une banque d'ADN à partir d'une pluralité de séquences nucléotidiques d'une population mélangée d'organismes et à séparer des clones contenant une séquence polynucléotidique d'intérêt sur un analyseur détectant une molécule détectable sur une sonde ou un substrat bioactif. L'analyseur comprend des dispositifs de triage cellulaire activés par fluorescence (FACS), des dispositifs supraconducteurs à interférences quantiques (SQID) et des dispositifs de spectroscopie à couplage multipôle (MCS). La banque séparée ou enrichie peut être à nouveau traitée par un criblage basé sur l'activité ou un criblage basé sur la séquence. De plus, la séquence enrichie peut être comparée à une base de données afin d'identifier des séquences dans la base de données présentant une homologie vis-à-vis d'un clone dans la banque, obtenant ainsi un profil d'acide nucléique de la population mélangée d'organismes.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NO, NZ, PH, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZA, ZW
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Eurasian Patent Office (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (EPO) (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)