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1. (WO2002031188) METHOD AND DEVICE FOR PREDICTING HAPLOTYPES
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2002/031188    International Application No.:    PCT/EP2001/011726
Publication Date: 18.04.2002 International Filing Date: 10.10.2001
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), G01N 33/48 (2006.01), G06F 17/18 (2006.01), G06F 19/18 (2011.01), G06F 19/22 (2011.01), G06F 19/24 (2011.01)
Applicants: GENPROFILE AG [DE/DE]; Robert-Rössle-Strasse 10 13125 Berlin (DE) (For All Designated States Except US).
SCHMIDT, Willi [DE/DE]; (DE) (For US Only)
Inventors: SCHMIDT, Willi; (DE)
Common
Representative:
V. BEZOLD & SOZIEN; Akademiestrasse 7 80799 München (DE)
Priority Data:
100 50 361.6 11.10.2000 DE
Title (DE) VERFAHREN UND VORRICHTUNG ZUR HAPLOTYPENVORHERSAGE
(EN) METHOD AND DEVICE FOR PREDICTING HAPLOTYPES
(FR) PROCEDE ET DISPOSITIF POUR PREVOIR DES HAPLOTYPES
Abstract: front page image
(DE)Es wird ein Verfahren zur Verarbeitung von Gensequenzen diploider Organismen beschrieben, bei dem für jeden betrachteten Genotyp g aus einer vorgegebenen Probandengruppe die Menge der möglichen Haplotypenpaare (x, y) und die Wahrscheinlichkeit ihres Auftretens vorhergesagt wird und die Schritte Ermittlung der Haplotypen x aus der Gesamtheit von Haplotypen, die mit dem Genotyp g kompatibel sind, Ermittlung von Paaren (x, y) von g-kompatiblen Haplotypen, aus denen der Genotyp g zusammengesetzt sein kann, Ermittlung der Wahrscheinlichkeiten h(g, x) der Haplotypenpaare durch ein statistisches Schätzverfahren, und Ausgabe, Speicherung und/oder Anzeige mindestens eines Haplotypenpaares, das eine vorgegebene Mindestwahrscheinlichkeit besitzt, vorgesehen sind.
(EN)The invention relates to a method for processing gene sequences of diploid organisms. According to said method, for each observed genotype g from a predetermined proband group, the quantity of the possible haplotype pairs (x, y) and the probability of their occurrence is predicted and the following steps are carried out: determination of the haplotypes x from the totality of haplotypes that are compatible with the genotype g; determination of pairs (x, y) of g-compatible haplotypes, of which the genotype g can be composed; determination of the probabilities h(g, x) of the haplotype pairs by a statistical estimation procedure and the output, storage and/or display of at least one haplotype pair, which has a predetermined minimum probability.
(FR)L'invention concerne un procédé pour traiter des séquences génétiques d'organismes diploïdes. Selon ce procédé, pour chaque génotype g observé à partir d'un groupe de proposants prédéterminé, la quantité de paires d'haplotypes potentielles (x, y) et leur probabilité d'apparition sont prévues et les étapes suivantes sont mises en oeuvre : détermination des haplotypes x à partir de la totalité des haplotypes qui sont compatibles avec le génotype g, détermination de paires (x, y) d'haplotypes compatibles avec g dont le génotype g peut être composé, détermination des probabilités h (g, x) des paires d'haplotypes par une méthode d'estimation statistique et sortie, stockage et/ou affichage d'au moins une paire d'haplotypes présentant une probabilité minimum prédéterminée.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DK, DM, DZ, EC, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NO, NZ, PH, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZA, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (GH, GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: German (DE)
Filing Language: German (DE)