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1. (WO2002031186) METHOD FOR THE DETECTION OF CYTOSINE METHYLATIONS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2002/031186    International Application No.:    PCT/DE2001/003901
Publication Date: 18.04.2002 International Filing Date: 10.10.2001
Chapter 2 Demand Filed:    06.05.2002    
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: EPIGENOMICS AG [DE/DE]; Kastanienallee 24, 10435 Berlin (DE) (For All Designated States Except US).
BERLIN, Kurt [DE/DE]; (DE) (For US Only)
Inventors: BERLIN, Kurt; (DE)
Agent: SCHUBERT, Klemens; Neue Promenade 5, 10178 Berlin (DE)
Priority Data:
100 50 942.8 10.10.2000 DE
Title (DE) VERFAHREN ZUM NACHWEIS VON CYTOSIN-METHYLIERUNGEN
(EN) METHOD FOR THE DETECTION OF CYTOSINE METHYLATIONS
(FR) PROCEDE DE DETECTION DE LA METHYLATION DE LA CYTOSINE
Abstract: front page image
(DE)Beschrieben wird ein Verfahren zur Detektion von Cytosin-Methylierung in genomischer DNA. Dazu wird zunächst genomische DNA-Probe mit einem Reagenz chemisch umgesetzt, wobei 5-Methylcytosin und Cytosin unterschiedlich reagieren und diese somit nach der Reaktion ein unterschiedliches Basenpaarungsverhalten in der DNA Duplex zeigen. Dann wird die vorbehandelte DNA unter Verwendung einer Polymerase und mindestens einem Primeroligonukleotid amplifiziert und das Amplifikat erneut mit einem Reagenz chemisch wie oben umgesetzt. Die in dem Amplifikat nach der erneuten chemischen Behandlung verbleibenden Cytosinbasen und/oder Guaninbasen werden im letzten Schritt nachgewiesen.
(EN)A method for the detection of cytosine methylations in genomic DNA is disclosed, whereby genomic DNA samples are firstly reacted with a chemical reagent, whereupon 5-methylcytosine and cytosine react differently and thus display a different base pair relationship in the DNA duplex after said reaction. The pre-treated DNA is then amplified by means of a polymerase and at least one primer oligonucleotide and the amplified material once again reacted with a chemical reagent as above. The cytosine bases and/or guanine bases remaining in the amplified material after the renewed chemical treatment are detected in the final step.
(FR)L'invention concerne un procédé permettant de détecter la méthylation de la cytosine dans l'ADN génomique. Selon ledit procédé, on fait d'abord réagir chimiquement l'échantillon d'ADN génomique avec un réactif, la 5-méthylcytosine et la cytosine réagissant de façon différente et présentant ainsi, après la réaction, des comportements d'appariement des bases différents dans le duplex d'ADN. Ensuite, on amplifie l'ADN prétraité au moyen d'une polymérase et d'au moins un oligonucléotide amorce, et l'on fait réagir le produit de cette amplification chimiquement avec un réactif, comme ci-dessus. Les bases du type cytosine et/ou guanine restant après ce nouveau traitement chimique sont, dans une dernière étape, détectées.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DK, DM, DZ, EC, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NO, NZ, PH, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZA, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (GH, GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: German (DE)
Filing Language: German (DE)