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1. (WO2002027036) PROBES, PROBE SETS, METHODS AND KITS PERTAINING TO THE DETECTION, IDENTIFICATION AND/OR ENUMERATION OF BACTERIA
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2002/027036    International Application No.:    PCT/US2001/029874
Publication Date: 04.04.2002 International Filing Date: 24.09.2001
Chapter 2 Demand Filed:    27.03.2002    
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: BOSTON PROBES, INC. [US/US]; 15 DeAngelo Drive Bedford, MA 01730 (US)
Inventors: HYLDIG-NIELSEN, Jens, J.; (US)
Agent: GILDEA, Brian, D.; Boston Probes, Inc. 15 DeAngelo Drive Bedford, MA 01730 (US)
Priority Data:
60/235,952 26.09.2000 US
Title (EN) PROBES, PROBE SETS, METHODS AND KITS PERTAINING TO THE DETECTION, IDENTIFICATION AND/OR ENUMERATION OF BACTERIA
(FR) SONDES, JEU DE SONDES, TECHNIQUES ET KITS CONCERNANT LA DETECTION, L'IDENTIFICATION ET/OU LE DENOMBREMENT DE BACTERIES
Abstract: front page image
(EN)This invention is related to novel probes, probe sets, methods and kits pertaining to the detection of bacteria of the Salmonella genus. The probes, probe sets, methods and kits of this invention are particularly useful for the detection, identification and/or enumeration of bacteria of the Salmonella genus. It is an advantage of the identified probes that they do not substantially cross react with bacteria of the closely related Citrobacter genus. Preferably, the probes of this invention are prepared as PNA probes and most preferably the probing nucleobase sequence comprises a segment that is at least ninety percent homologous to the nucleobase sequence; GTG-TTA-AAG-TGA-ACC (Seq. Id. No. 1), AGC-CIT-GAT-TTT-CCG (Seq.Id.No.2) or ACC-TAC-GTG-TCA-GCG (Seq.Id.No.3). Also disclosed is a particularly useful method for specifically detecting, identifying and/or quantitating organisms of a genus or species when the probes chosen possess overlap with certain organisms that are likely to contaminate the sample and otherwise lead to false positive results. The probes, probe sets, methods and kits of this invention are particularly well suited for use in ISH or FISH assays including assays of the multiplex format.
(FR)La présente invention concerne de nouvelles sondes, des jeux de sondes, des techniques et des kits concernant la détection de bactéries du genre salmonella. Les sondes, les jeux de sondes, les techniques et les kits de cette invention conviennent particulièrement pour la détection, l'identification et/ou le dénombrement de bactéries du genre salmonella. L'un des avantages de ces sondes identifiées vient du fait qu'elles n'ont sensiblement pas de réaction croisée avec les bactéries étroitement liées du genre citrobacter. Les sondes de cette invention sont de préférence préparées sous forme de sondes PNA et, encore mieux, la séquence de nucléobase de sondage comprend un segment qui est homologue au moins à 90 % de la séquence de nucléobase GTG-TTA-AAG-TGA-ACC (Seq. Id. No. 1), AGC-CIT-GAT-TTT-CCG (Seq.Id.No.2) ou ACC-TAC-GTG-TCA-GCG (Seq.Id.No.3). Cette invention concerne aussi une technique qui convient particulièrement bien pour détecter, identifier et/ou quantifier des organismes d'un genre ou d'une espèce, lorsque les sondes choisies possèdent un chevauchement avec certains organismes qui sont susceptibles de contaminer l'échantillon. Sans cette technique, on pourrait en effet déboucher sur des résultats positifs faux. Ces sondes, ces jeux de sondes, ces techniques et ces kits sont particulièrement bien adaptés pour une utilisation dans des dosages ISH ou FISH comprenant des dosages de format multicouche.
Designated States: JP.
European Patent Office (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE, TR).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)