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1. (WO2001034620) METHOD AND DEVICE FOR PRODUCING OLIGOMERS AND ARRAYS OF OLIGOMERS AND THE USE OF SAID DEVICE
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Pub. No.: WO/2001/034620 International Application No.: PCT/EP2000/011030
Publication Date: 17.05.2001 International Filing Date: 08.11.2000
Chapter 2 Demand Filed: 08.03.2001
IPC:
B01J 19/00 (2006.01) ,C07H 21/00 (2006.01)
B PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
01
PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
J
CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS, COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
19
Chemical, physical, or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
C CHEMISTRY; METALLURGY
07
ORGANIC CHEMISTRY
H
SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
21
Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
Applicants:
ADAMSCHIK, Mario [DE/DE]; DE (UsOnly)
EGGER, Cornelia [DE/DE]; DE (UsOnly)
HINZ, Michael [DE/DE]; DE (UsOnly)
HOFER, Eberhard, P. [DE/DE]; DE (UsOnly)
KOHN, Eberhard [DE/DE]; DE (UsOnly)
MAIER, Claus [DE/DE]; DE (UsOnly)
SELIGER, Hartmut [DE/DE]; DE (UsOnly)
MERCKLE GMBH [DE/DE]; Ludwig-Merckle-Strasse 3 89134 Blaubeuren, DE
Inventors:
ADAMSCHIK, Mario; DE
EGGER, Cornelia; DE
HINZ, Michael; DE
HOFER, Eberhard, P.; DE
KOHN, Eberhard; DE
MAIER, Claus; DE
SELIGER, Hartmut; DE
Agent:
PFENNING, MEINIG & PARTNER GBR; Mozartstrasse 17 80336 München, DE
Priority Data:
100 24 717.219.05.2000DE
199 54 009.810.11.1999DE
Title (EN) METHOD AND DEVICE FOR PRODUCING OLIGOMERS AND ARRAYS OF OLIGOMERS AND THE USE OF SAID DEVICE
(FR) PROCEDE ET DISPOSITIF DE PRODUCTION D'OLIGOMERES ET D'ARRANGEMENTS D'OLIGOMERES ET UTILISATION DU DISPOSITIF
(DE) VERFAHREN UND VORRICHTUNG ZUR HERSTELLUNG VON OLIGOMEREN UND ARRAYS VON OLIGOMEREN SOWIE DIE VERWENDUNG DER VORRICHTUNG
Abstract:
(EN) The invention relates to a method and a device for producing oligomers and arrays of oligomers, whereby the synthesis procedure is expanded by an additional neutralisation step. This allows the protecting groups to be split without any carry over, enabling the oligomers to be de-protected in precisely defined positions on the support material. A novel microelectromechanic device is used for said method, which enables exact addressing on a support material in the form of mono or multi-dimensional arrays by the integration of reaction chambers (13) and several liquid metering elements (1, 4, 5, 7, 8) in a chip. The invention aims to provide a method of creating oligomers or arrays of oligomers which are positioned in a precise manner in a small area, which has a minimal error rate during the creation of oligomer sequences as a result of the neutralisation step and its corresponding prevention of the distribution of the de-protection agent to positions which do not require de-protection. In addition, the device aims to permit the rapid production of oligomers and arrays thereof in a cost-effective manner.
(FR) L'invention concerne un procédé et un dispositif de production d'oligomères et d'arrangements d'oligomères, la procédé de synthèse étant complété par une opération de neutralisation supplémentaire. Cela permet une fission sans entraînement des groupes de protection, lesquels groupes permettent une déprotection des oligomères en des positions définies avec précision sur le matériau support. On utilise pour ce procédé un nouveau dispositif microélectromécanique qui permet un adressage exact sur le matériau support sous forme d'un arrangement monodimensionnel ou multidimensionnel par l'intégration de chambres de réaction (13) et plusieurs éléments doseurs de liquide (1, 4, 5, 7, 8) dans une puce. La solution selon l'invention doit permettre de créer des oligomères ou des arrangements d'oligomères qui sont positionnés avec précision dans un petit espace et qui, lors de la production des séquences oligomériques, présentent simultanément un taux d'erreur minimal dans des positions qui ne sont pas à déprotéger et ce, en raison de l'opération de neutralisation et la diffusion ainsi empêchée de l'agent de déprotection. En outre, le dispositif selon l'invention doit permettre une production économique et rapide d'oligomères et d'arrangements d'oligomères.
(DE) Die Erfindung betrifft ein Verfahren und eine Vorrichtung zur Herstellung von Oligomeren und Arrays von Oligomeren, wobei das Syntheseverfahren durch einen zusätzlichen Neutralisationsschritt erweitert wird. Dadurch wird eine verschleppungsfreie Abspaltung der Schutzgruppen ermöglicht, die eine Entschützung der Oligomere auf exakt definierten Positionen des Trägermaterials erlaubt. Für dieses Verfahren wird eine neuartige mikroelektromechanische Vorrichtung eingesetzt, die durch die Integration von Reaktionskammern (13) und mehreren Flüssigkeitsdosierelementen (1, 4, 5, 7, 8) in einem Chip eine genaue Adressierung auf einem Trägermaterial in Form eines ein- oder mehrdimensionalen Arrays erlaubt. Die erfindungsgemässe Lösung soll dabei eine Möglichkeit schaffen, Oligomere oder Arrays von Oligomeren zu schaffen, die zum einen auf kleinstem Raum exakt positioniert sind und gleichzeitig durch den Neutralisationsschritt und der damit verhinderten Verteilung des Entschützungsagens auf nicht zu entschützende Positionen eine minimale Fehlerquote bei der Erzeugung der Sequenzen der Oligomere aufweist. Mit Hilfe der erfindungsgemässen Vorrichtung soll zusätzlich die Möglichkeit geschaffen werden, mit geringem Aufwand in kurzer Zeit die Herstellung von Oligomeren und deren Arrays zu realisieren.
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Publication Language: German (DE)
Filing Language: German (DE)