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1. (WO2000056925) METHODS FOR SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM DETECTION
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Pub. No.: WO/2000/056925 International Application No.: PCT/US2000/006135
Publication Date: 28.09.2000 International Filing Date: 08.03.2000
Chapter 2 Demand Filed: 06.10.2000
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Q
MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1
Measuring or testing processes involving enzymes or micro-organisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
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involving nucleic acids
Applicants:
ACLARA BIOSCIENCES, INC. [US/US]; 1288 Pear Avenue Mountain View, CA 94043-1432, US
Inventors:
SINGH, Sharat; US
ULLMAN, Edwin, F.; US
Agent:
DEHLINGER, Peter; Iota Pi Law Suite 250 350 Cambridge Avenue Palo Alto, CA 94306, US
Priority Data:
60/125,31919.03.1999US
Title (EN) METHODS FOR SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM DETECTION
(FR) TECHNIQUES DE DETECTION DE POLYMORPHISMES NUCLEOTIDIQUES UNIQUES
Abstract:
(EN) Methods and compositions are provided for determining large numbers of single nucleotide polymorphisms in target DNA employing particles having (1) primers complementary to sequences in the target DNA where the next succeeding 3'-nucleotide is a potential single nucleotide polymorphism and coding composition members, where the members are unique for each primer, and (2) differentially labeled terminating nucleotides, where the label permits separation of the terminating nucleotides. Desirably the particles are separated into groups having a common prevalent next succeeding nucleotide. The particles and target DNA are combined under nucleotide extending conditions, the particles separated into groups in accordance with the terminating nucleotide and the coding members identified, so that one knows the sequence and the single nucleotide polymorophism. Various protocols are provided for the determination.
(FR) Cette invention a trait à des techniques et à des compositions permettant de déterminer un grand nombre de polymorphismes polynucléotidiques uniques dans de l'ADN cible et ce, grâce à l'utilisation de particules pourvues, (1), d'amorces complémentaires de séquences dans l'ADN cible dans lesquelles le nucléotide-3' suivant successif est, potentiellement, un polymorphisme nucléotidique unique, ces particules possédant des éléments de composition codante, et, (2), de nucléotides terminateurs marqués de façon différentielle, la marque permettant la séparation des nucléotides terminateurs. Les particules sont, de préférence, constituées en groupes ayant un nucléotide suivant successif commun prédominant. Les particules et l'ADN cible sont combinés dans des conditions d'extension de nucléotide, les particules constituées en groupe conformément au nucléotide terminateur et les éléments codants identifiés, de manière à connaître la séquence et le polymorphisme nucléotidique unique. L'invention porte également sur différents protocoles permettant cette détermination.
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Designated States: AU, CA, JP
European Patent Office (EPO) (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE)
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)