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1. WO2000043543 - DETECTION OF DIFFERENCES BETWEEN POLYNUCLEOTIDES

Publication Number WO/2000/043543
Publication Date 27.07.2000
International Application No. PCT/US1999/029222
International Filing Date 09.12.1999
Chapter 2 Demand Filed 07.07.2000
IPC
C12Q 1/68 2006.01
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68involving nucleic acids
CPC
C12Q 1/6827
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6813Hybridisation assays
6827for detection of mutation or polymorphism
Applicants
  • DADE BEHRING INC. [US/US]; 1717 Deerfield Road Deerfield, IL 60015, US
Inventors
  • KURN, Nurith; US
  • LIU, Yen, Ping; US
  • LISHANSKI, Alla; US
Agents
  • RUSZALA, Lois, K.; Dade Behring Inc. 1717 Deerfield Road Deerfield, IL 60015 , US
  • PATENTANWALTSKANZLEI ZOUNEK; Rheingaustrasse 190-196 D-65203 Wiesbaden, DE
Priority Data
09/233,98819.01.1999US
Publication Language English (EN)
Filing Language English (EN)
Designated States
Title
(EN) DETECTION OF DIFFERENCES BETWEEN POLYNUCLEOTIDES
(FR) DETECTION DES DIFFERENCES ENTRE POLYNUCLEOTIDES
Abstract
(EN)
A method is disclosed for detecting the presence of a difference between two related nucleic acid sequences. A complex is formed comprising both of the nucleic acid sequences in double stranded form. The complex comprises at least one pair of non-complementary strands and each of the non-complementary strands within the complex has a label. The complex is subjected to conditions wherein, if a difference between the two related nucleic acid sequences is present, strand exchange in the complex ceases and wherein, if no difference between the two related nucleic acid sequences is present, strand exchange in the complex continues until complete strand exchange occurs. A first signal is detected from the association of the labels as part of the complex. The association of the labels is related to the presence of the difference. A complex is also formed comprising the nucleic acid sequence suspected of comprising a difference in double stranded form and a predetermined amount of a non-relevant reference polynucleotide in double stranded form. The complex comprises at least one pair of non-complementary strands and each of the non-complementary strands within the complex has a label. A second signal from the association of the labels as part of the above complex is detected. A ratio of the first signal to the second signal is determined and related to the presence of the difference.
(FR)
Cette invention se rapporte à un procédé permettant de détecter la présence d'une différence entre deux séquences d'acide nucléique mises en relation. A cet effet, on forme un complexe comprenant les deux séquences d'acide nucléique sous forme de double brin. Ce complexe contient au moins une paire de brins non complémentaires et chacun de ces brins non complémentaires à l'intérieur du complexe possède une étiquette. Le complexe est soumis à des conditions telles que, si une différence entre les deux séquences d'acide nucléique mises en relation est présente, alors l'échange des brins dans le complexe cesse et, si aucune différence n'est présente entre les deux séquences d'acide nucléique mises en relation, alors l'échange des brins dans le complexe se poursuit jusqu'à ce qu'un échange complet des brins soit réalisé. Un premier signal est détecté à partir de l'association des étiquettes comme faisant partie du complexe. L'association des étiquettes est mise en relation avec la présence de la différence recherchée. On forme également un complexe comprenant la séquence d'acide nucléique suspectée de présenter une différence sous forme de double brin et une quantité prédéterminée d'un polynucléotide de référence non pertinent sous forme de double brin. Ce complexe contient au moins une paire de brins non complémentaires et chacun de ces brins non complémentaires à l'intérieur du complexe possède une étiquette. Un second signal provenant de l'association des étiquettes comme faisant partie de ce complexe est détecté. Un rapport entre le premier signal et le second signal est déterminé et mis en relation avec la présence de la différence.
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