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1. WO2000042222 - IMMOBILIZED NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION REAGENT AND METHOD

Publication Number WO/2000/042222
Publication Date 20.07.2000
International Application No. PCT/US2000/000806
International Filing Date 14.01.2000
Chapter 2 Demand Filed 05.07.2000
IPC
C12Q 1/68 2006.01
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68involving nucleic acids
CPC
C12Q 1/6818
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6813Hybridisation assays
6816characterised by the detection means
6818involving interaction of two or more labels, e.g. resonant energy transfer
C12Q 1/6837
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6813Hybridisation assays
6834Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
6837using probe arrays or probe chips
Applicants
  • GENE LOGIC INC. [US/US]; 708 Quince Orchard Road Gaithersburg, MD 20878, US (AllExceptUS)
  • CASS, Anthony [GB/GB]; GB (UsOnly)
  • VALAT, Christophe [FR/GB]; GB (UsOnly)
  • STEEL, Adam [US/US]; US (UsOnly)
Inventors
  • CASS, Anthony; GB
  • VALAT, Christophe; GB
  • STEEL, Adam; US
Agents
  • SANDERCOCK, Colin, G. ; Foley & Lardner 3000 K Street, N.W., Suite 500 Washington, DC 20007-5109, US
Priority Data
60/116,06315.01.1999US
Publication Language English (EN)
Filing Language English (EN)
Designated States
Title
(EN) IMMOBILIZED NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION REAGENT AND METHOD
(FR) REACTIF D'HYBRIDATION D'ACIDE NUCLEIQUE IMMOBILISE ET PROCEDE ASSOCIE
Abstract
(EN)
A fluorescently labeled nucleic acid having a hairpin structure between the fluorophore label and a point of attachment to a solid phase is useful as a probe to detect nucleic acid from a sample. The solid phase quenches the fluorophore label when the hairpin structure exists but this quenching is relieved by duplex formation between probe and a sample oligonucleotide. Probes for specific nucleic acid sequences can be immobilized as arrays on solid phase surfaces for detection of multiple nucleic acid sequences simultaneously from electrophoresis gels and from aqueous solutions. These probes and methods for their use can be combined with known solid phases, particularly those used for plasmon surface detection and electron transfer detection of nucleic acid. The probes can be washed and reused, and have other advantageous features over known probe methods.
(FR)
La présente invention porte sur un acide nucléique marqué par fluorescence ayant une structure en épingle à cheveux située entre le marqueur à fluorophore et un point de fixation à une phase solide qui est utile en tant que sonde pour détecter un acide nucléique dans un échantillon. La phase solide épuise le marqueur à fluorophore lorsque la structure en épingle à cheveux existe, cependant cet épuisement est atténué par la formation duplex entre la sonde et un oligonucléotide de l'échantillon. Des sondes destinées à des séquences nucléotidiques spécifiques peuvent être immobilisées sous forme de réseaux sur des surfaces de phase solide afin de détecter plusieurs séquences nucléotidiques simultanément à partir de gels d'électrophorèse et de solutions aqueuses. Ces sondes et leurs procédés d'utilisation peuvent être combinés avec des phases solides connues, particulièrement celles qu'on utilise pour la détection plasmonique de surface et la détection par transfert d'électrons d'acide nucléique. Lesdites sondes peuvent être lavées et réutilisées, elles possèdent en outre d'autres caractéristiques intéressantes par rapport aux autres procédés par sonde connus.
Also published as
Latest bibliographic data on file with the International Bureau