Processing

Please wait...

Settings

Settings

1. WO2000040751 - DETECTING NUCLEIC ACIDS

Publication Number WO/2000/040751
Publication Date 13.07.2000
International Application No. PCT/GB1999/004207
International Filing Date 20.12.1999
Chapter 2 Demand Filed 29.06.2000
IPC
C12Q 1/68 2006.01
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68involving nucleic acids
CPC
C12Q 1/6818
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6813Hybridisation assays
6816characterised by the detection means
6818involving interaction of two or more labels, e.g. resonant energy transfer
Applicants
  • THE VICTORIA UNIVERSITY OF MANCHESTER [GB/GB]; Oxford Road Manchester M13 9PL, GB (AllExceptUS)
  • DOUGLAS, Kenneth, Thomas [GB/GB]; GB (UsOnly)
  • BICHENKOVA, Elena, Vladimirovna [LV/GB]; GB (UsOnly)
Inventors
  • DOUGLAS, Kenneth, Thomas; GB
  • BICHENKOVA, Elena, Vladimirovna; GB
Agents
  • ATKINSON, Peter, Birch; Marks & Clerk Sussex House 83-85 Mosley Street Manchester M2 3LG, GB
Priority Data
9827912.819.12.1998GB
Publication Language English (EN)
Filing Language English (EN)
Designated States
Title
(EN) DETECTING NUCLEIC ACIDS
(FR) DETECTION D'ACIDES NUCLEIQUES
Abstract
(EN)
Methods are disclosed for analysing a sample to determine the presence or otherwise therein of a target polynucleotide sequence. The method involves treating the nucleic acid under hybridising conditions with first and second polynucleotide probes adapted to bind to adjacent mutually exclusive regions of the target sequence (if present). Each of the probes carries a different chromophoric moiety which is capable, with the other moiety, of forming an exciplex on photo-irradiation if the two probes are hybridised to the target sequence. Methods are disclosed for enhancing the exciplex emission and include the possibilities of (i) the first and second moieties coming into exciplex forming relationship in a localised region of greater hydrophobicity than the bulk phase of the sample being analysed; (ii) the first and second moieties coming into exciplex forming relationship within the immediate vicinity of the double stranded nucleic acid; (iii) there being included in the sample being analysed a compound capable of developing an exciplex fluorescent signal when the first and second moieties are in exciplex forming relationship; (iv) applying a magnetic field to enhance exciplex emission; and (v) the use of at least one of the steps, in either order, of (a) at least partial removal of relatively polar medium, and (b) addition of a less polar medium.
(FR)
L'invention porte sur des procédés d'analyse d'un échantillon visant à déterminer la présence ou autre d'une séquence polynucléotide cible. Ce procédé consiste à traiter l'acide nucléique dans des conditions d'hybridation avec des première et seconde sondes polynucléotidiques adaptées pour se lier à des régions exclusives adjacentes de la séquence cible (s'il y a). Chacune des sondes transporte une fraction chromophore différente capable, avec l'autre fraction, de former un exciplexe sur photo-irradiation si les deux sondes sont hybridées à la séquence cible. L'invention porte en outre sur des procédés visant à améliorer l'émission exciplexe et qui se caractérisent en ce que (i) les première et seconde fractions entrent en dans une relation formant un exciplexe dans une région localisée dont les propriétés hydrophobes sont supérieures à celles de la phase globale de l'échantillon en cours d'analyse ; (ii) les première et seconde fractions entrent dans une relation formant un exciplexe dans le voisinage immédiat de l'acide nucléique double brin ; (iii) dans l'échantillon en cours d'analyse est inclus un composé capable de développer un signal de fluorescence d'exciplexe lorsque les première et seconde fractions sont dans une relation formant un exciplexe ; (iv) on applique un champ magnétique pour intensifier l'émission d'exciplexe ; et (v) on effectue au moins une des étapes, dans un ordre quelconque, pour (a) retirer au moins partiellement un milieu relativement polaire et (b) ajouter un milieu moins polaire.
Other related publications
Latest bibliographic data on file with the International Bureau