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1. (WO2000028458) METHOD AND SYSTEM FOR DNA PATTERN ANALYSIS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2000/028458    International Application No.:    PCT/US1999/026329
Publication Date: 18.05.2000 International Filing Date: 05.11.1999
Chapter 2 Demand Filed:    06.06.2000    
IPC:
G06F 19/26 (2011.01)
Applicants: MITOKOR [US/US]; 11494 Sorrento Valley Road San Diego, CA 92121 (US) (For All Designated States Except US).
FAHY, Eoin, David [IE/US]; (US) (For US Only)
Inventors: FAHY, Eoin, David; (US)
Agent: ROSENMAN, Stephen, J.; Seed and Berry LLP 6300 Columbia Center 701 Fifth Avenue Seattle, WA 98104-7092 (US).
GOWSHALL J.V.; FORRESTER & BOEHMERT Franz-Joseph-Strasse 38 D-80801 Munchen (DE)
Priority Data:
60/107,360 06.11.1998 US
09/289,793 09.04.1999 US
Title (EN) METHOD AND SYSTEM FOR DNA PATTERN ANALYSIS
(FR) PROCEDE ET SYSTEME PERMETTANT D'ANALYSER DES COMPOSANTS D'ADN
Abstract: front page image
(EN)A system and corresponding method analyzes data for patterns, such as data produced from DNA sequencers. An ASCII text file, generated by DNA sequencer software, is used as the input source for the pattern analysis software program. This text file contains peak intensity data, identified by gel-lane and mobility, for bands corresponding to 2 sequences of differing length. The software uses gel-mobility values of control DNA samples to identify bands of interest from test samples in the dataset. Spurious data point or artifacts are filtered out in this selection process. The selected data is then imported to a second software program that performs algorithms such as linear progression and curve fitting.
(FR)L'invention concerne un système et un procédé correspondant qui permettent d'analyser des données destinées à identifier des composants, telles que des données obtenues à partir de séquenceurs d'ADN. Un fichier-texte ASCII, produit par un logiciel de séquençage d'ADN, sert de source d'entrée pour le programme d'analyse de composants d'ADN. Ce fichier-texte contient des données sur l'intensité de crête, identifiées par le trajet et la mobilité dans le gel, pour des bandes correspondant à deux séquences de longueurs différentes. Le logiciel utilise des valeurs de mobilité dans le gel issues d'échantillons témoins d'ADN pour identifier des bandes d'intérêt issues des échantillons d'essai de l'ensemble de données. Un point de données ou des artefacts parasites sont séparés par filtration pendant ce procédé de sélection. Les données sélectionnées sont ensuite importées dans un second programme qui réalise des algorithmes, par exemple, de progression linéaire ou d'ajustement des courbes.
Designated States: AE, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, CA, CH, CN, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, NO, NZ, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZA, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (GH, GM, KE, LS, MW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)