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1. (WO1999013109) METHOD FOR DNA SEQUENCING ANALYSIS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/1999/013109    International Application No.:    PCT/US1998/018808
Publication Date: 18.03.1999 International Filing Date: 10.09.1998
Chapter 2 Demand Filed:    09.04.1999    
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: SEQ, LTD. [US/US]; 17 Princess Road Lawrenceville, NJ 08648 (US) (For All Designated States Except US).
MACKLIN, John, J. [US/US]; (US) (For US Only).
TRAUTMAN, Jay, K. [US/US]; (US) (For US Only).
HARRIS, Timothy, D. [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: MACKLIN, John, J.; (US).
TRAUTMAN, Jay, K.; (US).
HARRIS, Timothy, D.; (US)
Agent: MORRIS, Francis, E.; Pennie & Edmonds LLP 1155 Avenue of the Americas New York, NY 10036 (US)
Priority Data:
60/058,642 11.09.1997 US
Title (EN) METHOD FOR DNA SEQUENCING ANALYSIS
(FR) PROCEDE D'ANALYSE DE SEQUENÇAGE D'ADN
Abstract: front page image
(EN)Cleaved nucleotides are affixed to a substrate so that each nucleotide is located at a different position on the substrate in the same order in which it was cleaved. The affixed nucleotides are then contacted with reagents that selectively convert one or more of the different types of nucleotides in place to products that have enhanced fluorescence. Where more than one type of nucleotide is so converted, the conversion product for each type of nucleotide advantageously has a fluorescence characteristic e.g., wavelength of maximum absorption or emission, or fluorescence lifetime) that is different from the fluorescence characteristic of the other conversion products. The conversion products are illuminated with electromagnetic radiation at a wavelength that is suitable for causing the conversion product to fluoresce. The fluorescence of each conversion product is detected as a function of the position of the conversion product on the substrate. Where the fluorescence of each conversion product is distinctive, detection of all the conversion products can be done simultaneously. Where the fluorescence of two ore more conversion products is not distinctive, each such product should be detected at a different time. The result of the foregoing process is a map that indicates the position on the substrate of the different conversion products that were caused to fluoresce. Since the position of the conversion products corresponds to the position of the nucleotides that were affixed to the substate and since the nucleotides were deposited on the substrate in the sequence in which they were cleaved, the map identifies the position in the oligonucleotide of those nucleotides that were converted to conversion products whose fluorescence was detected.
(FR)La présente invention concerne des nucléotides coupés, fixés à un substrat de sorte que chaque nucléotide est placé dans une position différente sur le substrat selon l'ordre dans lequel ils ont été coupés. Les nucléotides fixés sont ensuite mis en contact avec des réactifs qui transforment sélectivement un ou plusieurs types différents de nucléotides présents en produits qui améliorent la fluorescence. Lorsque plus d'un type de nucléotide est ainsi transformé, le produit de transformation pour chaque type de nucléotide présente avantageusement une caractéristique de fluorescence (par exemple, longueur d'onde d'absorption ou d'émission maximum, ou durée de vie de fluorescence) différente de la caractéristique de fluorescence des autres produits de transformation. Les produits de transformation sont éclairés par un rayonnement électromagnétique d'une longueur d'ondes permettant de provoquer une émission de fluorescence par le produit de transformation. La fluorescence de chaque produit de transformation est détectée sous forme d'une fonction de la position du produit de transformation sur le substrat. Lorsque la fluorescence de chaque produit de transformation est caractéristique, la détection de tous les produits de transformation peut être effectuée simultanément. Lorsque la fluorescence de deux ou plusieurs produits de transformation n'est pas caractéristique, chaque produit doit être détecté à un moment différent. Le procédé précédent produit une carte qui indique la position des différents produits de transformation qui ont provoqués la fluorescence. Du fait que la position des produits de transformation correspond à la position des nucléotides fixés au substrat et du fait que les nucléotides déposés sur le substrat dans la séquence dans laquelle ils ont été coupés, la carte identifie la position dans l'oligonucléotide des nucléotides transformés en produits de transformation dont la fluorescence a été détectée.
Designated States: AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, CA, CH, CN, CU, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, GB, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MD, MG, MK, MN, MW, MX, NO, NZ, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TR, TT, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (GH, GM, KE, LS, MW, SD, SZ, UG, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)