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1. (WO1998053097) METHOD FOR ISOLATION OF BIOSYNTHESIS GENES FOR BIOACTIVE MOLECULES
Latest bibliographic data on file with the International Bureau

Pub. No.: WO/1998/053097 International Application No.: PCT/CA1998/000488
Publication Date: 26.11.1998 International Filing Date: 21.05.1998
Chapter 2 Demand Filed: 16.12.1998
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Q
MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1
Measuring or testing processes involving enzymes or micro-organisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68
involving nucleic acids
Applicants:
TERRAGEN DIVERSITY INC. [CA/CA]; University of British Columbia Suite 300 2386 East Mall Vancouver, British Columbia V6T 1Z3, CA
Inventors:
WATERS, Barbara; CA
MIAO, Vivian, P., W.; CA
YAP, Wai, Ho; SG
SEOW, Kah, Tong; MY
Agent:
DEETH WILLIAMS WALL; National Bank Builing Suite 400 150 York Street Toronto, Ontario M5H 3S5, CA
Priority Data:
08/861,77422.05.1997US
Title (EN) METHOD FOR ISOLATION OF BIOSYNTHESIS GENES FOR BIOACTIVE MOLECULES
(FR) METHODE D'ISOLEMENT POUR LES GENES DE BIOSYNTHESE DE MOLECULES BIOACTIVES
Abstract:
(EN) Degenerate primers which hybridize with various classes of antibiotic biosynthesis gene were used to amplify fragments of DNA from soil and lichen extracts. Cloning and sequencing of the amplified products showed that these products included a variety of novel and previously uncharacterized antibiotic biosynthesis gene sequences, the products of which have the potential to be active as antibiotics, immunosuppressors, antitumor agents, etc. Thus, antibiotic biosynthesis genes can be recovered from soil or lichens by combining a sample with a pair of amplification primers under conditions suitable for polymerase chain reaction amplification, wherein the primer set is a degenerate primer set selected to hybridize with conserved regions of known antibiotic biosynthetic pathway genes, for example Type I and Type II polyketide synthase genes, isopenicillin N synthase genes, and peptide synthetase genes, cycling the combined sample through a plurality of amplification cycles to amplify DNA complementary to the primer set; and isolating the amplified DNA.
(FR) On utilise des amorces dégénérées, qui s'hybrident avec diverses classes de gènes de biosynthèse d'antibiotiques, afin d'amplifier des fragments d'ADN tirés du sol ou d'extraits de lichens. Le clonage et le séquençage des produits amplifiés ont montré que ces produits renferment une grande variété de séquences de gènes de biosynthèse d'antibiotiques jusque-là inconnus, dont les produits sont potentiellement actifs comme antibiotiques, immunosuppresseurs, agents antitumoraux, etc. Pour récupérer des gènes de biosynthèse à partir du sol ou de lichens, on combine un échantillon avec une paire d'amorces d'amplification, dans des conditions convenant pour l'amplification par PCR, l'ensemble d'amorces étant un ensemble d'amorces dégénérées choisi pour s'hybrider avec des régions conservées de certains gènes des voies connues de la biosynthèse d'antibiotiques, tels que les gènes de la polycétide synthase de type I et de type II, les gènes de l'isopénicilline N synthase et les gènes de la peptide synthase; on fait passer l'échantillon combiné par une pluralité de cycles d'amplification, de façon à amplifier l'ADN complémentaire de l'ensemble d'amorces; et on isole l'ADN amplifié.
Designated States: AU, CA, JP
European Patent Office (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE)
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)
Also published as:
AU1998074224