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1. (WO1996009410) TOPOGRAPHIC GENOTYPING
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/1996/009410    International Application No.:    PCT/US1995/012372
Publication Date: 28.03.1996 International Filing Date: 22.09.1995
Chapter 2 Demand Filed:    18.04.1996    
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: FINKELSTEIN, Sydney, D. [US/US]; (US).
FINKELSTEIN, Patricia, Anne [US/US]; (US)
Inventors: FINKELSTEIN, Sydney, D.; (US).
FINKELSTEIN, Patricia, Anne; (US)
Agent: SCHWARTZ, Ansel, M.; Suite 301, 425 N. Craig Street, Pittsburgh, PA 15213 (US)
Priority Data:
08/311,553 23.09.1994 US
Title (EN) TOPOGRAPHIC GENOTYPING
(FR) ETABLISSEMENT D'UN GENOTYPE TOPOGRAPHIQUE
Abstract: front page image
(EN)Method of topographic genotyping which comprises placing a biological specimen having DNA of a patient under a microscope, inspecting said specimen and choosing a microscopic-sized target based on its histopathologic characteristics. The target is then separated from the specimen and its DNA is isolated, amplified, and assayed for the presence of mutations. The present invention also pertains to a method of topographic genotyping which comprises the step of separating a section from a specimen of fixative-treated tissue, obtaining DNA from said section and amplifying the DNA by PCR using cycles which comprise heating to a temperature no greater than 99 °C and then cooling to a temperature of 55 °C in 5 mininutes for each cycle. Sequences with said DNA are then assayed for the presence of mutations. Preferably, the separating step includes the step of cutting one to three 2-6 micron thick histologic sections from the specimen.
(FR)Un procédé d'établissement d'un génotype topographique consiste à placer sous un microscope un spécimen biologique comportant de l'ADN d'un patient, à inspecter ce spécimen et à choisir une cible de taille microscopique en fonction de ses caractéristiques histopathologiques. On sépare alors cette cible du spécimen et on analyse, amplifie son ADN et on y recherche la présence de mutations. L'invention concerne aussi un procédé d'établissement d'un génotype topographique qui consiste à séparer une partie d'un spécimen d'un tissu traité avec un fixateur et à y prélever l'ADN qu'on amplifie par PCR en utilisant des cycles qui impliquent un chauffage jusqu'à une température ne dépassant pas 99 °C puis un refroidissement jusqu'à 55 °C en 5 minutes pour chaque cycle. On recherche alors la présence de mutations dans les séquences contenant cet ADN. L'étape de séparation comprend de préférence le découpage dans le spécimen d'une à trois sections histologiques allant de 2 à 6 microns d'épaisseur.
Designated States: CA, JP, US.
European Patent Office (AT, BE, CH, DE, DK, ES, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)