Processing

Please wait...

Settings

Settings

Goto Application

1. RU2012106432 - МАРКЕРЫ ДЛЯ РАКА ЭНДОМЕТРИЯ

Office Russian Federation
Application Number 2012106432/10
Application Date 23.07.2010
Publication Number 2012106432
Publication Date 27.08.2013
Publication Kind A
IPC
C12Q 1/68
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68involving nucleic acids
CPC
C12Q 1/6886
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
6883for diseases caused by alterations of genetic material
6886for cancer
C12Q 2600/112
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2600Oligonucleotides characterized by their use
112Disease subtyping, staging or classification
C12Q 2600/156
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2600Oligonucleotides characterized by their use
156Polymorphic or mutational markers
C12Q 2600/16
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2600Oligonucleotides characterized by their use
16Primer sets for multiplex assays
G01N 33/57442
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
33Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
48Biological material, e.g. blood, urine
50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
574for cancer
57407Specifically defined cancers
57442of the uterus and endometrial
G01N 2800/60
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
2800Detection or diagnosis of diseases
60Complex ways of combining multiple protein biomarkers for diagnosis
Applicants ХЕАДИК БИОТЕК, АИЭ. (ES)
Inventors АБАЛЬ-ПОСАДА Мигель (ES)
ДОЛЛЬ Андреас (ES)
ХИЛЬ-МОРЕНО Антонио (ES)
МАЕС Тамара (ES)
ПЕРЕС Кристина (ES)
РЕВЕНТОС-ПУИГХАНЕР Хауме (ES)
РОССЕЛЛЬ Элисабет (ES)
Priority Data 09166398.9 24.07.2009 EP
Title
(RU) МАРКЕРЫ ДЛЯ РАКА ЭНДОМЕТРИЯ
Abstract
(RU)
1. Диагностический способ in vitro для диагностики рака эндометрия, который включает (1) определение уровня от 1 до 17 биомаркера (ов), выбранных из Р4НВ, GMIP, IKBKE, FASTKD1, DDR1, SIRT6, PHKG2, АСАА1, АР1М2, EPS8L2, P2RX4, PPFIBP2, PPP1R16A, CGN, RASSF7, RNF183, и TJP3 в образце от пациента, где повышенный уровень указанных от 1 до 17 биомаркеров по сравнению с контрольным значением указывает на существование рака эндометрия и/или (2) определение уровня от 1 до 3 биомаркеров, выбранных из EFEMP2, SOCS2 и DCN, где сниженный уровень EFEMP2, SOCS2, и/или DCN по сравнению с контрольным значением указывает на существование рака эндометрия. 2. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, который включает определение уровня Р4НВ. 3. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, который включает определение уровня EFEMP2. 4. Способ in vitro в соответствии с п.1, который включает определение уровня IKBKE. 5. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, который включает определение уровня GMIP. 6. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.2, который дополнительно включает определение уровня одного или нескольких GMIP, IKBKE, или EFEMP2. 7. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.3, который дополнительно включает определение уровня одного или нескольких Р4НВ, IKBKE, или GMIP. 8. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.4, который дополнительно включает определение уровня одного или нескольких GMIP, EFEMP2, или Р4НВ. 9. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.2, который дополнительно включает определение уровня FASTKD1. 10. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.2, который дополнительно включает определение уровня DDR1. 11. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.2, который дополнительно включает определение уровня SIRT6. 12. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.2, который дополнительно включает определение уровня PHKG2. 13. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.2, который дополнительно включает определение уровня от 1 до 12 биомаркеров, выбранных из АСАА1, АР1М2, EPS8L2, P2RX4, PPFIBP2, PPP1R16A, CGN, RASSF7, RNF183, TJP3, SOCS2 и DCN. 14. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где указанный пациент имеет фактор риска для рака эндометрия или подвергается скринингу для рака эндометрия. 15. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где указанный образец от указанного пациента (получают) от указанного пациента с атипичным маточным кровотечением или где указанный пациент страдает от атипичного маточного кровотечения. 16. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где указанный образец от указанного пациента (получают) от указанного пациента, имеющего эндометрий с повышенной толщиной, или где указанный пациент имеет эндометрий с повышенной толщиной. 17. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где указанный образец от указанного пациента (получают) от пре-менопаузного, пери-менопаузного или пост-менопаузного пациента или где указанный пациент представляет собой пре-менопаузный, пери-менопаузный или пост-менопаузный пациент. 18. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.17, где указанный пациент является пре-менопаузным. 19. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.17, где указанный пациент является пери-менопаузным. 20. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.17, где указанный пациент является пост-менопаузным. 21. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где указанный образец выбирают из образца ткани, крови и/или сыворотки, и маточной жидкости. 22. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.21, где указанный образец представляет собой образец маточной жидкости. 23. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.22, где указанный образец маточной жидкости получают путем аспирации. 24. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где уровень биомаркеров определяют с помощью антитела. 25. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где уровень биомаркера (ов) определяют с помощью ОТ-ПЦР. 26. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где указанные маркеры выбирают из Р4НВ, IKBKE, EFEMP2, SOCS2, FASTKD1, GMIP, DDR1, SIRT6, PHKG2, EPS8L2, и PPP1R16A, P2RX4, RASSF7, и TJP3. 27. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где указанный (е) маркер (ы) выбирают из P2RX4, Р4НВ, PHKG2, PPFIBP2, и SOCS2. 28. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где указанный (е) маркер (ы) выбирают из Р4НВ, RASSF7, RNF183 и IKBKE. 29. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где определяют от 2 до 20 маркеров. 30. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где определяют комбинацию следующих маркеров: Р4НВ, EFEMP2, SIRT6, GMIP, FASTKD1 и DDR1. 31. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где определяют комбинацию следующих маркеров: Р4НВ, EFEMP2, SIRT6, GMIP, FASTKD1 и PHKG2. 32. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где определяют комбинацию следующих маркеров: Р4НВ, EFEMP2, SIRT6, АСАА1, АР1М2, EPS8L2, IKBKE, P2RX4, PPFIBP2 и PPP1R16A. 33. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, где определяют один или несколько дополнительных биомаркеров. 34. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.33, где указанные один или несколько дополнительных биомаркеров выбирают из дифференциальных диагностических биомаркеров, прогностических биомаркеров, биомаркеров, пригодных для обнаружения рака эндометрия, биомаркеров для классификации рака эндометрия и вспомогательных биомаркеров для обнаружения рака эндометрия. 35. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.33, где один или несколько дополнительных биомаркеров выбирают из дифференциальных диагностических биомаркеров. 36. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.33, где один или несколько вспомогательных биомаркеров выбирают из прогностических маркеров. 37. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.33, где один или несколько вспомогательных биомаркеров выбирают из маркеров классификации рака эндометрия. 38. Нуклеиновая кислота, выбранная из IKBKE мРНК, кДНК, или их комплемента; Р4НВ мРНК, кДНК, или их комплемента; SOCS2 мРНК, кДНК, или их комплемента; GMIP мРНК, кДНК, или их комплемента; DDR1 мРНК, кДНК, или их комплемента; EPS8L2 мРНК, кДНК, или их комплемента; и PPP1R16A мРНК, кДНК, или их комплемента, для применения для диагностики рака эндометрия. 39. Нуклеиновая кислота, выбранная из Праймеров для IKBKE; Праймеров для Р4НВ; Праймеров для SOCS2; Праймеров для GMIP; Праймеров для DDR1; Праймеров для EPS8L2; и Праймеров для PPP1R16A; для применения для диагностики рака эндометрия. 40. Нуклеиновая кислота, выбранная из зонда для IKBKE; зонда для Р4НВ; зонда для SOCS2; зонда для GMIP; зонда для DDRI; зонда для EPS8L2; и зонда для PPP1R16A, для применения для диагностики рака эндометрия. 41. Набор, включающий два или больше зондов в соответствии с п.40, для применения для диагностики рака эндометрия. 42. Набор, включающий праймеры для двух или больше пар праймеров в соответствии с п.39 для применения для диагностики рака эндометрия. 43. Антитело, выбранное из антитела к IKBKE; антитела к Р4НВ; антитела к SOCS2; антитела к GMIP; антитела к DDRI; антитела к EPS8L2; и антитела к PPP1R16A, для применения для диагностики рака эндометрия. 44. Набор, содержащий антитела к двум или больше антителам в соответствии с п.43 для применения для диагностики рака эндометрия. 45. Набор для получения маточной жидкости для применения для диагностики рака эндометрия путем оценки уровней от 1-20 биомаркеров, как определено в п.1. 46. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, который включает определение уровня 2 биомаркеров. 47. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, который включает определение уровня 3 биомаркеров. 48. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, который включает определение уровня 4 биомаркеров. 49. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, который включает определение уровня 5 биомаркеров. 50. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, который включает определение уровня 7 биомаркеров. 51. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, который включает определение уровня 10 биомаркеров. 52. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, который включает определение уровня 15 биомаркеров. 53. Диагностический способ in vitro в соответствии с п.1, который включает определение уровня 20 биомаркеров. 54. Диагностический способ in vitro для диагностики рака эндометрия, который включает получение образца аспирата маточной жидкости от пациента, имеющего симптом или фактор риска для рака эндометрия, и определение уровня от 1 до 100 биомаркеров, маркеров, которые дифференциально экспрессируются при раке эндометрия по сравнению с контрольными значениями, характерными для особей, не страдающих от рака эндометрия, где (1) если уровень от 1 до 100 биомаркеров повышен в образце аспирата эндометрия у пациента и в контрольных значениях, то пациент имеет повышенную вероятность наличия рака эндометрия и где (2) если уровень от 1 до 100 биомаркеров понижен в образце аспирата и тогда пациент имеет повышенную вероятность наличия рака эндометрия. 55. Нуклеиновая кислота, выбранная из АСАА1 мРНК, кДНК, или их комплемента; АР1М2 мРНК, кДНК, или их комплемента; CGN мРНК, кДНК, или их комплемента; FASTKD1 мРНК, кДНК, или их комплемента; P2RX4 мРНК, кДНК, или их комплемента; RASSF7 мРНК, кДНК, или их комплемента; RNF183 мРНК, кДНК, или их комплемента; PHKG2 мРНК, кДНК, или их комплемента; PPFIBP2 мРНК, кДНК, или их комплемента, IRT6 мРНК, кДНК, или их комплемента, TJP3 мРНК, кДНК, или их комплемента; EFEMP2 мРНК, кДНК, или их комплемента; и DCN мРНК, кДНК, или их комплемента, для применения для диагностики рака эндометрия. 56. Нуклеиновая кислота, выбранная из Праймеров для АСАА1; Праймеров для АР1М2; Праймеров для CGN; Праймеров для FASTKD1; Праймеров для P2RX4; Праймеров для RASSSF7; Праймеров для RNF183; Праймеров для SIRT6; Праймеров для PPFIBP2; Праймеров для PHKG2; Праймеров для TJP3; Праймеров для EFEMP2; и Праймеров для DCN; для применения для диагностики рака эндометрия. 57. Нуклеиновая кислота, выбранная из зонда для АСАА1; зонда для АР1М2; зонда для CGN; зонда для FASTKD1; зонда для P2RX4; зонда для RASSF7; зонда для RNF183; зонда для SIRT6; зонда для PPFIBP2; зонда для PKHG2; зонда для TJP3; зонда для EFEMP2; и зонда для DCN, для применения для диагностики рака эндометрия. 58. Антитело, выбранное из антитела к АСАА1; антитела к АР1М2; антитела к CGN; антитела к FASTKD1; антитела к P2RX4; антитела к RASSF7; антитела к RNF183; антитела к SIRT6; антитела к PPFIBP2; антитела к PKHG2; антитела к TJP3; антитела к EFEMP2; и антитела к DCN, для применения для диагностики рака эндометрия рака эндометрия. 59. Диагностический способ in vitro для диагностики рака эндометрия, который включает обеспечение или получение образца маточной жидкости от пациента-человека, который имеет симптом или фактор риска для рака женских половых органов и определение уровня экспрессии РНК от 2 до 9 биомаркеров, выбранных из Р4НВ, EFEMP2, GMIP, IKBKE, DDR1, FASTKD1, SIRT6, PKHG2, и SOCS2 с помощью количественной ПЦР, где повышенный уровень от 1 до 7 биомаркеров, выбранных из Р4НВ, GMIP, IKBKE, DDR1, FASTKD1, SIRT6, и PKHG2 и/или сниженный уровень EFEMP2 или SOCS2 по сравнению с контролем указывает на существование рака эндометрия. 60. Способ в соответствии с пунктом 59, где рак женских половых органов представляет собой рак эндометрия. 61. Способ в соответствии с пунктом 59, где маркеры представляют собой 2-8 биомаркеров, выбранных из Р4НВ, EFEMP2, GMIP, IKBKE, DDR1, FASTKD1, SIRT6, и PKHG2. 62. Способ в соответствии с пунктом 59, где маркеры представляют собой 2-8 биомаркеров, выбранных из Р4НВ, GMIP, IKBKE, DDR1, FASTKD1, SIRT6, PKHG2, и SOCS2. 63. Способ в соответствии с пунктом 1, где указанное определение уровня включает контактирование указанного одного или нескольких биомаркеров с праймерами и реагентами, способными амплифицировать специфически указанные один или несколько биомаркеров и определение уровня указанного амплифицированного одного или нескольких биомаркеров с зондом или зондами, которые гибридизируются с указанным амплифицированным биомаркером. 64. Способ в соответствии с пунктом 63, где указанный зонд гибридизируется специфически с указанным амплифицированным биомаркером. 65. Способ в соответствии с любым из пп.1-37, 46-54 и 59-64, где определяют Р4НВ и EFEMP2. 66. Способ в соответствии с любым из пп.1-37, 46-54 и 59-64, где определяют Р4НВ и IKBKE. 67. Способ в соответствии с любым из пп.1-37, 46-54 и 59-64, где определяют Р4НВ и GMIP. 68. Способ в соответствии с любым из пп.1-37, 46-54 и 59-64, где определяют EFEMP2 и IKBKE. 69. Способ в соответствии с любым из пп.1-37, 46-54 и 59-64, где определяют EFEMP2 и Р4НВ. 70. Способ в соответствии с любым из пп.1-37, 46-54 и 59-64, где определяют Р4НВ, GMIP, и IKBKE. 71. Способ в соответствии с любым из пп.1-37, 46-54 и 59-64, где определяют комбинацию маркеров, где указанная комбинация включает IKBKE и Р4НВ; IKBKE и SOCS2; Р4НВ и SOCS2; GMIP и IKBKE; GMIP и Р4НВ; GMIP и SOCS2; GMIP, SOCS2, и IKBKE; GMIP, SOCS2, и Р4НВ; GMIP, IKBKE, и Р4НВ; IKBKE, P4HB, и SOCS2; GMIP, IKBKE, Р4НВ, и SOCS2; GMIP, SOCS2, IKBKE, и EPS8L2; GMIP, SOCS2, Р4НВ, и EPS8L2; GMIP, IKBKE, Р4НВ, и EPS8L2; IKBKE, Р4НВ, SOCS2, и EPS8L2; GMIP, IKBKE, Р4НВ, SOCS2, и DDR1; GMIP, IKBKE, Р4НВ, SOCS2, EPS8L2, и PPP1R16A; GMIP, IKBKE, Р4НВ, SOCS2, PHKG2, и RASSF7; GMIP, IKBKE, Р4НВ, SOCS2, EPS8L2, и DDR1; GMIP, IKBKE, Р4НВ, SOCS2, EPS8L2, PPP1R16A, и DDR1; DDR1, EPS8L2, GMIP, IKBKE, P2RX4, Р4НВ, PHKG2, PPP1R16A, RASSF7, SIRT6, TJP3, и SOCS2; или DDR1, EPS8L2, GMIP, IKBKE, P2RX4, Р4НВ, PHKG2, PPP1R16A, RASSF7, SIRT6, TJP3, RNF183 и SOCS2. 72. Способ в соответствии с любым из пп.1-37, 46-54 и 59-64, где определяют комбинацию маркеров, где указанная комбинация включает GMIP, IKBKE, Р4НВ, SOCS2 и FASTKD1; GMIP, IKBKE, Р4НВ, SOCS2 и DDR1; GMIP, IKBKE, Р4НВ, SOCS2 и PHKG2; GMIP, IKBKE, Р4НВ, SOCS2 и SIRT6; GMIP, IKBKE, P4HB, SOCS2 и АСАА1; GMIP, IKBKE, P4HB, SOCS2 и EFEMP2; GMIP, IKBKE, P4HB, SOCS2 и EPS8L2; GMIP, IKBKE, P4HB, SOCS2 и P2RX4; GMIP, IKBKE, P4HB, SOCS2 и PPFIBP2; GMIP, IKBKE, P4HB, SOCS2 и PPP1R16A; GMIP, IKBKE, P4HB, SOCS2, АСАА1 и FASTKD1; GMIP, IKBKE, P4HB, SOCS2, PHKG2 и FASTKD1; GMIP, IKBKE, P4HB, SOCS2, SIRT6 и FASTKD1; АСАА1, AP1M2, EPS8L2, IKBKE, P2RX4, P4HB, PPFIBP2, PPP1R16A, SIRT6, и EFEMP2; GMIP, IKBKE, P4HB, и EFEMP2; DDR1, FASTKD1, PHKG2, SIRT6, SOCS2, GMIP, IKBKE, P4HB, и EFEMP2; DDR1, FASTKD1, PHKG2, SIRT6, GMIP, IKBKE, P4HB, и EFEMP2; или P4HB, EFEMP2, IKBKE, GMIP, и FASTKD1. 73. Способ в соответствии с любым из пп.1-37, 46-54 и 59-64, где определяют комбинацию маркеров, где указанная комбинация включает GMIP, IKBKE, P4HB, EFEMP2 и FASTKD1; GMIP, IKBKE, P4HB, EFEMP2 и DDR1; GMIP, IKBKE, P4HB, EFEMP2 и PHKG2; GMIP, IKBKE, P4HB, EFEMP2 и SIRT6; GMIP, IKBKE, P4HB, EFEMP2 и АСАА1; GMIP, IKBKE, P4HB, SOCS2 и EFEMP2; GMIP, IKBKE, P4HB, EFEMP2 и EPS8L2; GMIP, IKBKE, P4HB, EFEMP2 и P2RX4; GMIP, IKBKE, P4HB, EFEMP2 и PPFIBP2; GMIP, IKBKE, P4HB, EFEMP2 и PPP1R16A; GMIP, IKBKE, P4HB, EFEMP2, АСАА1 и FASTKD1; GMIP, IKBKE, P4HB, EFEMP2, PHKG2 и FASTKD1; или GMIP, IKBKE, P4HB, EFEMP2, SIRT6 и FASTKD1. 74. Диагностический способ in vitro в соответствии с любым из пп.1-37, 46-54 и 59-74, который включает обеспечение образца маточной жидкости, полученного от пациента с помощью устройства Пайпиля или шприца, где пациент имеет фактор риска или симптом рака эндометрия; контактирование указанного образца с агентом, способным предохранять, предотвращать или ослаблять деградацию РНК в указанном образце маточной жидкости; определение в указанном образце уровня экспрессии мРНК, соответствующей указанным от 1 до 20 маркерам и одного или нескольких эндогенных генов, используя количественную ПЦР; нормализацию уровня экспрессии указанного от 1 до 20 биомаркеров с одним или несколькими эндогенными генами; сравнение нормализованного уровня от 1 до 20 биомаркеров с контрольным значением, где дифференциальная экспрессия от 1 до 20 биомаркеров указывает на рак эндометрия или повышенную вероятность рака эндометрия. 75. Способ в соответствии с п.75, где указанные один или несколько эндогенных генов выбирают из POLR2A, В2М, PFN1, HMBS, G6PD, и PABPN1.

Other related publications