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1. WO2021204642 - PCR BASED DIAGNOSTIC KIT, COMPOSITIONS AND METHODS FOR AMPLIFICATION AND DETECTION OF SARS-COV-2

Publication Number WO/2021/204642
Publication Date 14.10.2021
International Application No. PCT/EP2021/058556
International Filing Date 01.04.2021
IPC
C12Q 1/70 2006.1
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
70involving virus or bacteriophage
Applicants
  • FAST TRACK DIAGNOSTICS LUXEMBOURG S.À.R.L. [LU]/[LU]
Inventors
  • EDUARDO CORREIA, Benedito
  • GILLES, Alexandre Jean M
  • MENARD, Ludovic
Agents
  • LIER, Simone
Priority Data
62/705,20816.06.2020US
63/005,78106.04.2020US
Publication Language English (EN)
Filing Language English (EN)
Designated States
Title
(EN) PCR BASED DIAGNOSTIC KIT, COMPOSITIONS AND METHODS FOR AMPLIFICATION AND DETECTION OF SARS-COV-2
(FR) KIT DE DIAGNOSTIC À BASE DE PCR, COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS D'AMPLIFICATION ET DE DÉTECTION DE SRAS-COV-2
Abstract
(EN)
The present application is directed to a method for detecting presence or absence of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) in a sample. The method first involves contacting the sample with a primary oligonucleotide primer set. The primary oligonucleotide primer set comprises: (i) a first oligonucleotide primer comprising a nucleotide sequence complementary to a first portion of the SARS-CoV-2 transmembrane domain 2 gene, and (ii) a second oligonucleotide primer comprising a nucleotide sequence complementary to an extension product formed from the first oligonucleotide primer of the primary oligonucleotide primer set. The method can further involve contacting the sample with a secondary oligonucleotide primer set, where the secondary primer set comprises (i) a first oligonucleotide primer comprising a nucleotide sequence complementary to a first portion of the SARS-CoV-2 N gene, and (ii) a second oligonucleotide primer comprising a nucleotide sequence complementary to an extension product formed from the first oligonucleotide primer of the secondary oligonucleotide primer set. The contacted sample is subjected to an amplification reaction under conditions suitable for producing transmembrane domain 2 gene and N gene amplification products, and the presence or absence of SARS-CoV-2 in the sample is detected. Isolated oligonucleotides, primer sets, and kits are also disclosed.
(FR)
La présente invention concerne un procédé de détection de la présence ou de l'absence de coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) dans un échantillon. Le procédé consiste d'abord à mettre en contact l'échantillon avec un ensemble d'amorces oligonucléotidiques primaires. L'ensemble d'amorces oligonucléotidiques primaires comprend (I) une première amorce oligonucléotidique comprenant une séquence nucléotidique complémentaire d'une première partie du gène du domaine transmembranaire du SARS-CoV-2, et (ii) une seconde amorce oligonucléotidique comprenant une séquence nucléotidique complémentaire d'un produit d'extension formé à partir de la première amorce oligonucléotidique de l'ensemble d'amorces oligonucléotidiques primaires. Le procédé peut en outre consister à mettre en contact l'échantillon avec un ensemble d'amorces oligonucléotidiques secondaires, l'ensemble d'amorces secondaires comprenant (i) une première amorce oligonucléotidique comprenant une séquence nucléotidique complémentaire d'une première partie du gène N du SARS-CoV-2, et (ii) une seconde amorce oligonucléotidique comprenant une séquence nucléotidique complémentaire d'un produit d'extension formé à partir de la première amorce oligonucléotidique de l'ensemble d'amorces oligonucléotidiques secondaires. L'échantillon mis en contact est soumis à une réaction d'amplification dans des conditions appropriées pour produire un gène du domaine transmembranaire 2 et des produits d'amplification du gène N, et la présence ou l'absence de SARS-CoV-2 dans l'échantillon est détectée. Des oligonucléotides isolés, des ensembles d'amorces et des kits sont également divulgués.
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