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1. WO2021160843 - SYSTEMS AND METHODS FOR IMAGING SAMPLES WITH REDUCED SAMPLE MOTION ARTIFACTS

Publication Number WO/2021/160843
Publication Date 19.08.2021
International Application No. PCT/EP2021/053525
International Filing Date 12.02.2021
IPC
G02B 21/00 2006.1
GPHYSICS
02OPTICS
BOPTICAL ELEMENTS, SYSTEMS, OR APPARATUS
21Microscopes
G02B 21/36 2006.1
GPHYSICS
02OPTICS
BOPTICAL ELEMENTS, SYSTEMS, OR APPARATUS
21Microscopes
36arranged for photographic purposes or projection purposes
G01N 21/64 2006.1
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
21Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using infra-red, visible or ultra-violet light
62Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
63optically excited
64Fluorescence; Phosphorescence
Applicants
  • SAMANTREE MEDICAL SA [CH]/[CH]
Inventors
  • NAUMENKO, Andrey
  • HORISBERGER, Aurèle Timothée
  • JOSS, Diego
  • SCHMITT, Frédéric
  • SHAFFER, Etienne
  • PIROLET, Jonathan Abel
  • RACHET, Bastien
  • LOGVINOV, Andrew
Agents
  • GRAHAM WATT & CO LLP
Priority Data
62/975,74212.02.2020US
Publication Language English (EN)
Filing Language English (EN)
Designated States
Title
(EN) SYSTEMS AND METHODS FOR IMAGING SAMPLES WITH REDUCED SAMPLE MOTION ARTIFACTS
(FR) SYSTÈMES ET PROCÉDÉS POUR IMAGER DES ÉCHANTILLONS AVEC DES ARTEFACTS DE MOUVEMENT D'ÉCHANTILLON RÉDUITS
Abstract
(EN)
Systems and methods to identify and/or reduce or eliminate sample motion artifacts are disclosed. Sample motion artifacts may be reduced or eliminated using scan patterns where an acquisition time difference between when perimeter pixels in adjacent tiles are acquired is reduced, as compared to a conventional raster scan to reduce or eliminate discontinuities that would otherwise appear at tile boundaries in an image. In some embodiments, test images acquired using relatively small test scan patterns or intensities of test points acquired at different times may be compared to determine whether sample motion has occurred. In some embodiments, intensity of adjacent pixels at a tile boundary are compared. In some embodiments, intensity of one or more single pixels is monitored over time to determine whether sample motion has occurred over a period of time. In some embodiments, a flattening or reshaping tool may be used to suppress sample motion during imaging.
(FR)
La présente invention concerne des systèmes et des procédés pour identifier et/ou réduire ou éliminer des artefacts de mouvement d'échantillon. Des artefacts de mouvement d'échantillon peuvent être réduits ou éliminés à l'aide de motifs de balayage dans lesquels une différence entre des temps d'acquisition, auxquels des pixels de périmètre dans des carreaux adjacents sont acquis, est réduite, en comparaison à un balayage de trame classique pour réduire ou éliminer des discontinuités qui apparaîtraient sinon aux frontières de carreaux dans une image. Dans certains modes de réalisation, des images de test acquises à l'aide de motifs de balayage de test relativement petits ou des intensités de points de test acquises à différents temps peuvent être comparées pour déterminer si un mouvement d'échantillon est survenu. Dans certains modes de réalisation, les intensités de pixels adjacents au niveau d'une frontière de carreaux sont comparées. Dans certains modes de réalisation, l'intensité d'un ou de plusieurs pixels individuels est surveillée dans le temps pour déterminer si un mouvement d'échantillon est survenu au cours d'une période de temps. Dans certains modes de réalisation, un outil d'aplatissement ou de remodelage peut être utilisé pour supprimer un mouvement d'échantillon durant l'imagerie.
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